132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1108 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 
673 aa  1393    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0742  hypothetical protein  54.74 
 
 
377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000011109  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1163  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  68.06 
 
 
277 aa  389  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0743  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  68.16 
 
 
291 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0512045  hitchhiker  0.00111999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0677  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  67.72 
 
 
271 aa  365  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  36.49 
 
 
296 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3755  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.4 
 
 
307 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  37.12 
 
 
285 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0261  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.64 
 
 
264 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1897  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.72 
 
 
294 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.16 
 
 
275 aa  148  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.59 
 
 
296 aa  148  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.59 
 
 
296 aa  148  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2646  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.95 
 
 
297 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.88 
 
 
273 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4704  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.07 
 
 
286 aa  146  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0118751  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  36.65 
 
 
296 aa  143  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5102  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.69 
 
 
301 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2199  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.83 
 
 
288 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608262 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.72 
 
 
303 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.32 
 
 
291 aa  138  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4115  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.21 
 
 
530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.83 
 
 
304 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5496  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.58 
 
 
286 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  34.06 
 
 
253 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  33.04 
 
 
253 aa  120  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  34.35 
 
 
263 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  33.04 
 
 
253 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.8 
 
 
263 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.04 
 
 
251 aa  117  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  31.74 
 
 
253 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2173  DNA adenine methyltransferase  32.17 
 
 
232 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.134955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  31 
 
 
274 aa  115  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  31.49 
 
 
271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.33 
 
 
265 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  0.0000277159 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.55 
 
 
284 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  33.03 
 
 
323 aa  107  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  33.03 
 
 
262 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  33.03 
 
 
262 aa  107  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.49 
 
 
264 aa  106  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3388  DNA adenine methylase, putative  32.42 
 
 
264 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.18 
 
 
284 aa  105  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.88 
 
 
262 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  29.57 
 
 
259 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  32.2 
 
 
251 aa  101  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.33 
 
 
254 aa  101  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.19 
 
 
310 aa  99  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.49 
 
 
263 aa  98.6  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.9 
 
 
263 aa  95.1  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.9 
 
 
263 aa  95.1  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  0.00000213835 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  27.95 
 
 
263 aa  91.3  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0660  prophage PSPPH06, putative adenine modification methytransferase  29.81 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  31.43 
 
 
268 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.89 
 
 
305 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.99 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  31.02 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  32.07 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  32.07 
 
 
268 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  28.21 
 
 
262 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.51 
 
 
268 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0647  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.04 
 
 
704 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0836  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.56 
 
 
348 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0670  DNA adenine methylase  44.71 
 
 
163 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0429675  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.99 
 
 
274 aa  69.7  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  25.71 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  27.83 
 
 
283 aa  63.9  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  23.81 
 
 
319 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  23.81 
 
 
319 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  32.8 
 
 
278 aa  62  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.26 
 
 
306 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  28.02 
 
 
273 aa  61.2  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.83 
 
 
306 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  24.48 
 
 
727 aa  57.4  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1631  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.41 
 
 
289 aa  54.3  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  26.41 
 
 
280 aa  54.3  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  23.39 
 
 
638 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  25.81 
 
 
286 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00507  DNA adenine methylase  25.31 
 
 
293 aa  53.5  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  23.38 
 
 
279 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  23.76 
 
 
280 aa  52.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.19 
 
 
283 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  26.29 
 
 
277 aa  52.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0378  DNA adenine methylase  24.07 
 
 
278 aa  52.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  24.8 
 
 
274 aa  51.6  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  26.73 
 
 
289 aa  52  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  26.25 
 
 
277 aa  51.6  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20420  DNA adenine methylase Dam  24.9 
 
 
305 aa  50.8  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.180762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3963  DNA adenine methylase  25.98 
 
 
271 aa  50.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3724  DNA adenine methylase  25.98 
 
 
271 aa  50.8  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00179541  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0228  DNA adenine methylase  25.98 
 
 
271 aa  50.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0459983  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1835  DNA adenine methylase  25.62 
 
 
302 aa  50.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1606  putative adenine-specific DNA methyltransferase  23.79 
 
 
284 aa  50.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.299391  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  23.01 
 
 
275 aa  50.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  25.2 
 
 
279 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.27 
 
 
287 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4602  DNA adenine methylase  25.6 
 
 
270 aa  49.7  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0997785  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  25.2 
 
 
279 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.34 
 
 
292 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0263  DNA adenine methylase  23.94 
 
 
275 aa  48.9  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.262484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3800  DNA adenine methylase  26.32 
 
 
288 aa  48.9  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  0.175069 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>