57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2173 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2173  DNA adenine methyltransferase  100 
 
 		 232 aa  484  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.134955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4704  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  51.77 
 
 		 286 aa  241  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0118751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  48.29 
 
 		 285 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3755  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  46.78 
 
 		 307 aa  213  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  47.01 
 
 		 296 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4115  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  45.26 
 
 		 530 aa  194  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5102  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  44.4 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0261  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  46.4 
 
 		 264 aa  191  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  44.39 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  42.67 
 
 		 303 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5496  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  41.3 
 
 		 286 aa  175  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2199  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  40.69 
 
 		 288 aa  170  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2646  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  40.43 
 
 		 297 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1897  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  38.82 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1163  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.36 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0743  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.06 
 
 		 291 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0512045  hitchhiker  0.00111999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0677  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.75 
 
 		 271 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.17 
 
 		 673 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.33 
 
 		 304 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.19 
 
 		 273 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.43 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.43 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  30 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.11 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.45 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.84 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.45 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  25.93 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3388  DNA adenine methylase, putative  30.46 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  22.42 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6518  phage DNA methylase  36.9 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4258  phage DNA methylase  33.6 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0105966 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.19 
 
 		 263 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  27.03 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  27.03 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  28.49 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.45 
 
 		 310 aa  51.6  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  28.49 
 
 		 268 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.42 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.32 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  0.0000277159 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  27.93 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  27.93 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0660  prophage PSPPH06, putative adenine modification methytransferase  29.05 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.5 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  24.46 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.77 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  24.49 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.38 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  27.34 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  26.53 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.28 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  0.00000213835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.28 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  26.62 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  22.94 
 
 		 323 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  27.34 
 
 		 262 aa  41.6  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  27.34 
 
 		 262 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>