164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3758 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 
275 aa  572  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0261  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  62.06 
 
 
264 aa  329  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  57.66 
 
 
296 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  59.48 
 
 
285 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4115  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  58.36 
 
 
530 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5102  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  57.14 
 
 
301 aa  308  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2646  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  54.21 
 
 
297 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5496  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  52.27 
 
 
286 aa  265  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4704  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  50.18 
 
 
286 aa  255  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0118751  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2199  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  49.62 
 
 
288 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3755  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  47.81 
 
 
307 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  47.73 
 
 
303 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1897  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  43.38 
 
 
294 aa  198  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2173  DNA adenine methyltransferase  44.39 
 
 
232 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.134955 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1163  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  38.91 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.16 
 
 
673 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0743  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.41 
 
 
291 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0512045  hitchhiker  0.00111999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0677  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.12 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  38.11 
 
 
273 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  40.18 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.06 
 
 
304 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  33.45 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.58 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.58 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.09 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.93 
 
 
291 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  34.17 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  31.96 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.61 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  36.16 
 
 
268 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  29.92 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  34.82 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  34.38 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.91 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.19 
 
 
263 aa  93.2  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.12 
 
 
274 aa  92.8  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  33.19 
 
 
251 aa  92.4  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.65 
 
 
263 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  30 
 
 
323 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  29.28 
 
 
259 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  29.55 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  29.55 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.64 
 
 
262 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  30 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  30 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  28.64 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  27.65 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.47 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.05 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  0.0000277159 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  27.16 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  27.16 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  31.52 
 
 
263 aa  79  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  29.02 
 
 
274 aa  78.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.05 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.05 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  0.00000213835 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.46 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.34 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3388  DNA adenine methylase, putative  28.44 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0647  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.66 
 
 
704 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.5 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  30.91 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0836  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.76 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.18 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  28.21 
 
 
292 aa  62.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  25 
 
 
283 aa  62.4  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  27.23 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  24.9 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6518  phage DNA methylase  34.4 
 
 
224 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1090  DNA adenine methylase  23.94 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4258  phage DNA methylase  36.04 
 
 
224 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0105966 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0660  prophage PSPPH06, putative adenine modification methytransferase  27.32 
 
 
225 aa  57.4  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  27.34 
 
 
288 aa  55.8  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0874  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.4 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0166  DNA adenine methylase  25.29 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.7 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  26.7 
 
 
277 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  26.5 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  24.38 
 
 
273 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  26.8 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4057  DNA adenine methylase  24.02 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000515222  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2725  DNA adenine methylase  24.29 
 
 
276 aa  52.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.24 
 
 
306 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  25.13 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3085  Site-specific DNA methylase protein  28.95 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.34 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4602  DNA adenine methylase  24.09 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0997785  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1835  DNA adenine methylase  29.69 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  40 
 
 
280 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1110  retron adenine methylase  24.21 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.588496 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  25.13 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  28.5 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  26.23 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0263  DNA adenine methylase  32.32 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.262484  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  25.13 
 
 
279 aa  49.7  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0250  DNA adenine methylase  25.13 
 
 
279 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0670  DNA adenine methylase  35.11 
 
 
163 aa  49.3  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0429675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  25.38 
 
 
279 aa  48.9  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3880  DNA adenine methylase  23.14 
 
 
270 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33854  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  38.71 
 
 
277 aa  48.9  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1480  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.44 
 
 
293 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>