169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2199 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2199  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 
288 aa  580  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5102  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  58.84 
 
 
301 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4115  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  58.58 
 
 
530 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0261  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  54.95 
 
 
264 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2646  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  52.08 
 
 
297 aa  278  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3755  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  47.78 
 
 
307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  49.62 
 
 
275 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4704  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  48.56 
 
 
286 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0118751  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  49.27 
 
 
296 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  49.11 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  48.55 
 
 
303 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5496  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  41.67 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1897  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  44.73 
 
 
294 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2173  DNA adenine methyltransferase  40.69 
 
 
232 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.134955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  40.96 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0743  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.7 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0512045  hitchhiker  0.00111999 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.67 
 
 
304 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1163  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.97 
 
 
277 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.83 
 
 
673 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0677  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.74 
 
 
271 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.62 
 
 
296 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.62 
 
 
296 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  34.62 
 
 
296 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.1 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.78 
 
 
291 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.04 
 
 
284 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  34.05 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  36.73 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  30.57 
 
 
253 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  30.57 
 
 
253 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  30.57 
 
 
253 aa  89.4  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.04 
 
 
263 aa  89  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  36.22 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  34.39 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  30.94 
 
 
263 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.96 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.48 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.88 
 
 
262 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3388  DNA adenine methylase, putative  29.65 
 
 
264 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.55 
 
 
251 aa  85.9  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  31.49 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  28.96 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  28.96 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  34.17 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  31.44 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.17 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  34.17 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.21 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  0.0000277159 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.57 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  29.84 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.06 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.06 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  0.00000213835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0166  DNA adenine methylase  24.9 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  28.65 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.98 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  28.8 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.93 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  32.97 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0647  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.34 
 
 
704 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  27.88 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  25 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  25 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.91 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  25.97 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  27.19 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  28.72 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002330  methyl-directed repair DNA adenine methylase  27.19 
 
 
279 aa  63.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.455912  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  28.78 
 
 
277 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  30 
 
 
294 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3756  DNA adenine methylase  25.41 
 
 
278 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  25.76 
 
 
277 aa  62.4  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3852  DNA adenine methylase  25.41 
 
 
278 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3683  DNA adenine methylase  25.41 
 
 
278 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00514879  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3790  DNA adenine methylase  25.41 
 
 
278 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0828962  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3681  DNA adenine methylase  25.41 
 
 
278 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0836  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.94 
 
 
348 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  30.05 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  25.42 
 
 
279 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.78 
 
 
305 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  27.41 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2725  DNA adenine methylase  25.78 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.09 
 
 
306 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0241  DNA adenine methylase  26.84 
 
 
279 aa  59.7  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808773  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3800  DNA adenine methylase  25 
 
 
288 aa  59.3  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1115  DNA adenine methylase Dam  27.27 
 
 
277 aa  59.3  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.664514  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  26.64 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  29.47 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2203  DNA adenine methylase  25.45 
 
 
277 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4262  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  24.66 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0349455 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2320  DNA adenine methylase  26.44 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.3975  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4057  DNA adenine methylase  26.13 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000515222  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3839  DNA adenine methylase  27.68 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.236937  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  26.74 
 
 
288 aa  56.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  28.95 
 
 
279 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3880  DNA adenine methylase  26.5 
 
 
270 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33854  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0264  DNA adenine methylase  24.52 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0659762  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  28.36 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  28.5 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  28.36 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.94 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.469174 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>