120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5555 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 
304 aa  621  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  57.52 
 
 
273 aa  292  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0261  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  39.54 
 
 
264 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2199  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.67 
 
 
288 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3755  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.5 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4704  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.11 
 
 
286 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0118751  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1163  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  38.17 
 
 
277 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  35.4 
 
 
296 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5102  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.01 
 
 
301 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.76 
 
 
303 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2646  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.52 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.83 
 
 
673 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4115  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.61 
 
 
530 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.06 
 
 
275 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  35.53 
 
 
285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0743  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.93 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0512045  hitchhiker  0.00111999 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.02 
 
 
296 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.02 
 
 
296 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.81 
 
 
291 aa  122  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  34.66 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1897  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.17 
 
 
294 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0677  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.14 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5496  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.35 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  28.21 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.3 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.52 
 
 
284 aa  93.6  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2173  DNA adenine methyltransferase  31.33 
 
 
232 aa  91.3  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.134955 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.25 
 
 
254 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  27.15 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.99 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.14 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  27.34 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  29.1 
 
 
263 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  27.5 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.24 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  27.31 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  27.23 
 
 
253 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  27.23 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  26.34 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.05 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  0.0000277159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3388  DNA adenine methylase, putative  27.11 
 
 
264 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.31 
 
 
263 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  25.76 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  25.76 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2134  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.07 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0629434  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  26.64 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4258  phage DNA methylase  44.09 
 
 
224 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0105966 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  26.42 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  26.42 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.63 
 
 
274 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6518  phage DNA methylase  39.45 
 
 
224 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  25.32 
 
 
307 aa  63.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0647  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.35 
 
 
704 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  25.57 
 
 
251 aa  62.8  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.75 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  28.1 
 
 
262 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  27.19 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  25.33 
 
 
280 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0384  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  21.51 
 
 
277 aa  59.7  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.558909  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  28.62 
 
 
268 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  26.26 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.08 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.12 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.12 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  0.00000213835 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  27.55 
 
 
277 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  29.22 
 
 
268 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  26.07 
 
 
277 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.7 
 
 
321 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  24.56 
 
 
280 aa  56.2  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  28.73 
 
 
268 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  28.45 
 
 
268 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.23 
 
 
268 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0836  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  41.77 
 
 
348 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  20.21 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  20.21 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  26.46 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  22.36 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1631  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.29 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.68 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.57 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  21.83 
 
 
279 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  23.84 
 
 
277 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  23.14 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00507  DNA adenine methylase  25 
 
 
293 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  21.83 
 
 
279 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1606  putative adenine-specific DNA methyltransferase  21.78 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.299391  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0166  DNA adenine methylase  21.03 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  23.67 
 
 
289 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0061  DNA-methyltransferase  24 
 
 
324 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.41 
 
 
305 aa  50.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2725  DNA adenine methylase  23.96 
 
 
276 aa  49.3  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1098  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.39 
 
 
332 aa  49.3  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000180295 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1587  DNA adenine methylase Dam  27.71 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.893709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  24.77 
 
 
290 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  24.5 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  23.56 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3756  DNA adenine methylase  22.47 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3790  DNA adenine methylase  22.47 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0828962  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3681  DNA adenine methylase  22.47 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3683  DNA adenine methylase  22.47 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00514879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>