39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0878 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0878  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 		 296 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0291145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2017  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  40.94 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1631  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.82 
 
 		 289 aa  192  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1480  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.48 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1606  putative adenine-specific DNA methyltransferase  36.9 
 
 		 284 aa  175  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.299391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3299  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.74 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3545  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  39.18 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.164224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0632  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.14 
 
 		 281 aa  152  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7315  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.8 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000824248  hitchhiker  0.000000113371 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0050  prophage Lp2 protein 3  38.31 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.287398  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0061  DNA-methyltransferase  31.25 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0503  site-specific DNA methylase-like protein  26.69 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1098  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.36 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000180295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.87 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.26 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0874  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.28 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  25.75 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  25.75 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.91 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3706  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.64 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.56 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2134  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.43 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0629434  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.56 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1749  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.87 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0183349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2437  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.59 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0384  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.95 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.558909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4539  DNA adenine methylase  25 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  22.81 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1790  DNA adenine methylase  21.31 
 
 		 263 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.557139  normal  0.0298379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2236  DNA adenine methylase  25.33 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00406547  hitchhiker  0.0000680943 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2890  DNA adenine methylase  21.65 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  27.41 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6518  phage DNA methylase  34.78 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1464  DNA adenine methylase  26.32 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000122278  normal  0.830812 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.19 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0202  DNA adenine methylase  23.23 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.790639  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  21.26 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.1 
 
 		 284 aa  43.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.92 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>