More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0829 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 370 aa  743    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  70.54 
 
 		 375 aa  531  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  70.19 
 
 		 371 aa  525  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  69.57 
 
 		 370 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  68.83 
 
 		 395 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  68.83 
 
 		 377 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  68.21 
 
 		 376 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  68.83 
 
 		 373 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  65.95 
 
 		 374 aa  501  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  65.68 
 
 		 381 aa  504  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  66.67 
 
 		 377 aa  503  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  66.03 
 
 		 369 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  65.76 
 
 		 376 aa  496  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  67.48 
 
 		 375 aa  494  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  65.85 
 
 		 373 aa  492  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  67.75 
 
 		 372 aa  488  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  67.66 
 
 		 370 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  66.58 
 
 		 370 aa  490  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  67.66 
 
 		 370 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  67.66 
 
 		 370 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  67.21 
 
 		 376 aa  481  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  67.57 
 
 		 374 aa  481  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  63.24 
 
 		 376 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  64.85 
 
 		 378 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  65.68 
 
 		 374 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  63.24 
 
 		 376 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  65.5 
 
 		 374 aa  461  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  59.89 
 
 		 372 aa  455  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  61.35 
 
 		 375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  61.62 
 
 		 393 aa  444  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  60.27 
 
 		 417 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  62.77 
 
 		 385 aa  438  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  59.1 
 
 		 379 aa  434  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  58.2 
 
 		 380 aa  436  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  57.99 
 
 		 387 aa  428  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  61.14 
 
 		 369 aa  428  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  59.08 
 
 		 378 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  55.56 
 
 		 382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  42.16 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  29.69 
 
 		 383 aa  150  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  26.96 
 
 		 410 aa  102  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  28.31 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  23.53 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  26.85 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  24.86 
 
 		 357 aa  96.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  25.98 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  26.04 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  24.66 
 
 		 358 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  24.66 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  27.39 
 
 		 396 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  26.26 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  26.7 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  25.76 
 
 		 357 aa  90.1  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1278  phosphoserine aminotransferase  25.22 
 
 		 360 aa  90.1  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  25.9 
 
 		 363 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  28.07 
 
 		 363 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  25.67 
 
 		 381 aa  89.7  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  24.85 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1375  phosphoserine aminotransferase  26.98 
 
 		 335 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  26.37 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  26.69 
 
 		 358 aa  87.4  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  26.63 
 
 		 390 aa  87  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1359  phosphoserine aminotransferase  26.69 
 
 		 335 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416954  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  26.08 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  28.03 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  26.98 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  26.69 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  28.12 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  26.08 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1270  phosphoserine aminotransferase  25.77 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  29.36 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1171  phosphoserine aminotransferase  26.55 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3162  phosphoserine aminotransferase  25.84 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1732  phosphoserine aminotransferase  25.72 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.443235  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  26.91 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  25.83 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  25.97 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3487  phosphoserine aminotransferase  27.15 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.146301 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  24.59 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  27.27 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2000  phosphoserine aminotransferase  26.18 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.572206  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  26.79 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  28.46 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  25.42 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  26.1 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0477  phosphoserine aminotransferase  25.74 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108745 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2803  phosphoserine aminotransferase  27.72 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128725  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2421  phosphoserine aminotransferase  25.56 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000598679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1719  phosphoserine aminotransferase  25.71 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.442694 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2708  phosphoserine aminotransferase  27.72 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  23.74 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1350  phosphoserine aminotransferase  23.06 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  28.18 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  25.35 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  23.4 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0009  phosphoserine aminotransferase  25.81 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  26.09 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  26.83 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1687  phosphoserine aminotransferase  25.84 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1314  phosphoserine aminotransferase  25.64 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>