More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2434 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  100 
 
 		 338 aa  703    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  55.14 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  42.53 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  35.59 
 
 		 357 aa  193  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  34.44 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  31.39 
 
 		 363 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  31.92 
 
 		 373 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  28.65 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  29.49 
 
 		 374 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  29.75 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  29.83 
 
 		 370 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  28.9 
 
 		 370 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  28.61 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  29.3 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  28.33 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  28.77 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  28.93 
 
 		 369 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  28.82 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  28.45 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  26.06 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  29.94 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  28.09 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  25.98 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  28.53 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  27.84 
 
 		 417 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  29.41 
 
 		 395 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  27.27 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  26.69 
 
 		 376 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  27.12 
 
 		 357 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  29.26 
 
 		 375 aa  97.1  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  29.75 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  29.75 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  29.75 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  29.06 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  28.77 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  24.36 
 
 		 360 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  26.63 
 
 		 357 aa  93.2  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  27.27 
 
 		 378 aa  92.4  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  26.45 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  29.07 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  28.01 
 
 		 376 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  26.7 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  27.27 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  26.48 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  26.28 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  26.46 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  27.73 
 
 		 355 aa  86.7  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  26.42 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  25.07 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  26.14 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  25 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  27.76 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  25.28 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  24.79 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  26.91 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  28.32 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  25.68 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  25.85 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  24.3 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  26.61 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  27.27 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  26.8 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  25.55 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  26.89 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  26.79 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  25.07 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  25.77 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  25.14 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  27.12 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  25.35 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  24.86 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  26.45 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  25.78 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  26.54 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  25.64 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  23.94 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  24.8 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  23.01 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  24.86 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  25.98 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  24.8 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  25.21 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  24.8 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  22.92 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  27.14 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  25.34 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  23.61 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  24.7 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  24.72 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  24.42 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  25.81 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1702  aminotransferase class V  27.44 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  25.64 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  22.07 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  25.63 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  25.46 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  24.34 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  24.93 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  26.39 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  22.67 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>