More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4691 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  100 
 
 		 357 aa  738    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  61.43 
 
 		 363 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  47.86 
 
 		 361 aa  351  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  35.59 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  34.77 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  30.4 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  30.39 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  30.39 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  30.96 
 
 		 358 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  28.42 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  30.6 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  30.46 
 
 		 357 aa  126  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  29.53 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  30.46 
 
 		 357 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  28.81 
 
 		 374 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  28.38 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  28.26 
 
 		 374 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  28.01 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  28.22 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  27.95 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  28.61 
 
 		 370 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  26.7 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  28.33 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  29.38 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  28.45 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  28.41 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  27.27 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  26.33 
 
 		 377 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  27.3 
 
 		 370 aa  106  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  26.37 
 
 		 370 aa  106  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  25.76 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  27.93 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  27.04 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  26.17 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  26.76 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  26.26 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  26.57 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  26.74 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  25.98 
 
 		 374 aa  99.4  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  28.93 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  26.44 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  26.1 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  26.37 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  26.84 
 
 		 369 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  25.91 
 
 		 375 aa  97.1  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  24.86 
 
 		 370 aa  96.7  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  25.35 
 
 		 380 aa  95.9  9e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  26.84 
 
 		 370 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  26.84 
 
 		 370 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  26.84 
 
 		 370 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  27.47 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  26 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  26 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  28.18 
 
 		 362 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  26.24 
 
 		 373 aa  93.2  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  25.14 
 
 		 372 aa  89.7  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  25.48 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  27.12 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  27.56 
 
 		 377 aa  86.7  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1719  phosphoserine aminotransferase  27.35 
 
 		 375 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.442694 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  25 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  26.56 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  25.35 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  29.28 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  25.36 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1817  putative aminotransferase  27.52 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  25.39 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  28.66 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  26.22 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  24.79 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1687  phosphoserine aminotransferase  26.13 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1631  phosphoserine aminotransferase  26.13 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1498  phosphoserine aminotransferase  27.48 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  24.15 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1454  phosphoserine aminotransferase  26.54 
 
 		 362 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2708  phosphoserine aminotransferase  26.47 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2803  phosphoserine aminotransferase  26.47 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128725  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1443  phosphoserine aminotransferase  28.3 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103698  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  26.52 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2443  phosphoserine aminotransferase  24.53 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  26.52 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  24.65 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0638  phosphoserine aminotransferase  26.46 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1232  phosphoserine aminotransferase  26.01 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  24.72 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  23.86 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0870  aminotransferase, class V  25.71 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2622  phosphoserine aminotransferase  26.18 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.699254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  24.59 
 
 		 387 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  26.89 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  24.93 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0619  phosphoserine aminotransferase  26.4 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  25.15 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  25.82 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  27.84 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  28.63 
 
 		 383 aa  69.3  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  27.45 
 
 		 394 aa  69.3  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  25.56 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  27.65 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  26.06 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>