More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1004 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  100 
 
 		 369 aa  751    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  82.7 
 
 		 370 aa  614  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  77.57 
 
 		 370 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  73.12 
 
 		 373 aa  568  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  75.95 
 
 		 376 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  72.31 
 
 		 373 aa  559  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  70.54 
 
 		 376 aa  551  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  69.07 
 
 		 375 aa  542  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  70.65 
 
 		 377 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  71.35 
 
 		 377 aa  544  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  68.75 
 
 		 374 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  67.75 
 
 		 371 aa  531  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  67.66 
 
 		 395 aa  529  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  68.03 
 
 		 376 aa  526  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  71.54 
 
 		 374 aa  527  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  70.67 
 
 		 374 aa  520  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  67.65 
 
 		 370 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  67.65 
 
 		 370 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  67.65 
 
 		 370 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  65.33 
 
 		 381 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  66.03 
 
 		 370 aa  498  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  65.87 
 
 		 375 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  66.4 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  66.13 
 
 		 375 aa  491  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  64.5 
 
 		 376 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  63.14 
 
 		 376 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  67.03 
 
 		 374 aa  485  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  65.85 
 
 		 372 aa  478  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  65.14 
 
 		 369 aa  467  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  62.2 
 
 		 378 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  60.27 
 
 		 372 aa  444  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  62.06 
 
 		 385 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  58.18 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  57.64 
 
 		 379 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  56.79 
 
 		 387 aa  423  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  56.4 
 
 		 382 aa  413  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  58.31 
 
 		 378 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  54.52 
 
 		 380 aa  408  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  45.92 
 
 		 373 aa  302  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  30.49 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  28.93 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  28.21 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4686  phosphoserine aminotransferase  28.39 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0966475  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  26.84 
 
 		 357 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  27.07 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  27.14 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  24.18 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  26.87 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  26.04 
 
 		 360 aa  94  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  27.02 
 
 		 346 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  29.48 
 
 		 357 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  27.85 
 
 		 375 aa  93.2  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4468  phosphoserine aminotransferase  26.04 
 
 		 395 aa  92.8  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0805419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  26.83 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  27 
 
 		 357 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  26.2 
 
 		 390 aa  90.1  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  27 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  27 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  26.56 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1278  phosphoserine aminotransferase  23.1 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  25.83 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3596  phosphoserine aminotransferase  26.63 
 
 		 392 aa  86.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  27.2 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  26.3 
 
 		 370 aa  86.7  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  25.27 
 
 		 357 aa  86.3  8e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  26.6 
 
 		 396 aa  85.9  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3162  phosphoserine aminotransferase  26.19 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  25.88 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1332  phosphoserine aminotransferase  25.42 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  26.2 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2619  phosphoserine aminotransferase  26.09 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  25.47 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  27.82 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4790  phosphoserine aminotransferase  25.92 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  24.59 
 
 		 374 aa  82.8  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  24.29 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  26.2 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  26 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1314  phosphoserine aminotransferase  25.39 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  26.78 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3906  phosphoserine aminotransferase  25.13 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1270  phosphoserine aminotransferase  24.87 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3193  phosphoserine aminotransferase  25.17 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1857  phosphoserine aminotransferase  23.43 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.729123  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_004310  BR1687  phosphoserine aminotransferase  26.23 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0477  phosphoserine aminotransferase  23.86 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2969  phosphoserine aminotransferase  26.48 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  23.63 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3625  phosphoserine aminotransferase  26.27 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0111727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0617  phosphoserine aminotransferase  26.2 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0735  phosphoserine aminotransferase  25.34 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000198961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  26.5 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  27.32 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2803  phosphoserine aminotransferase  26.18 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  22.03 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6961  phosphoserine aminotransferase  23.94 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2137  phosphoserine aminotransferase  24.4 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2708  phosphoserine aminotransferase  26.18 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0260  phosphoserine aminotransferase  25.54 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  25.95 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>