More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10901 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 
376 aa  759    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  81.18 
 
 
371 aa  626  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  80.32 
 
 
395 aa  622  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  83.47 
 
 
370 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  83.47 
 
 
370 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  83.47 
 
 
370 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  72.28 
 
 
374 aa  566  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  68.24 
 
 
381 aa  546  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  70.29 
 
 
375 aa  543  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  68.56 
 
 
376 aa  537  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  70.11 
 
 
377 aa  537  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  68.03 
 
 
369 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  66.67 
 
 
370 aa  511  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  67.02 
 
 
376 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  65.68 
 
 
373 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  65.86 
 
 
374 aa  501  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  65.3 
 
 
370 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  65.76 
 
 
370 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  63.69 
 
 
373 aa  492  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  63.71 
 
 
377 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  67.57 
 
 
372 aa  490  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  63.4 
 
 
374 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  63.51 
 
 
375 aa  478  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  61.25 
 
 
376 aa  472  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  61.02 
 
 
372 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  63.83 
 
 
378 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  63.64 
 
 
374 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  59.89 
 
 
376 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  61.01 
 
 
375 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  61.52 
 
 
417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  58.97 
 
 
387 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  60.38 
 
 
385 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  59.84 
 
 
393 aa  437  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  60.33 
 
 
369 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  56.91 
 
 
379 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  55.71 
 
 
382 aa  408  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  55.79 
 
 
380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  58.15 
 
 
378 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  41.69 
 
 
373 aa  289  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  28.43 
 
 
383 aa  137  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  27.17 
 
 
346 aa  103  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  26.22 
 
 
363 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  26.74 
 
 
357 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  26.58 
 
 
375 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  25.49 
 
 
361 aa  98.6  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  25.88 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  28.01 
 
 
338 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42458  phosphoserine transaminase  26.18 
 
 
409 aa  89.7  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.809086  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  23.88 
 
 
360 aa  89.4  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  25.71 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  27.05 
 
 
357 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  24.86 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1332  phosphoserine aminotransferase  24.4 
 
 
371 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  26.01 
 
 
370 aa  87.4  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  23.94 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2969  phosphoserine aminotransferase  25.13 
 
 
390 aa  86.3  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  24.15 
 
 
410 aa  86.3  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  24.87 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4790  phosphoserine aminotransferase  25.45 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0638  phosphoserine aminotransferase  24.8 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612941  normal  0.204061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0260  phosphoserine aminotransferase  26.81 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  24.73 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  25.81 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3906  phosphoserine aminotransferase  24.42 
 
 
389 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  27.3 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  24.8 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  25.55 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4107  phosphoserine aminotransferase  24.35 
 
 
390 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  25.77 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  25.77 
 
 
385 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  24.46 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  26.54 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5460  phosphoserine aminotransferase  24.6 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0670  phosphoserine aminotransferase  24.01 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.786402  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1314  phosphoserine aminotransferase  24.42 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0009  phosphoserine aminotransferase  26.12 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1203  phosphoserine aminotransferase  25.86 
 
 
391 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509685  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0617  phosphoserine aminotransferase  26.88 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3162  phosphoserine aminotransferase  25.13 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0659  phosphoserine aminotransferase  24.54 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.381901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  26.54 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  24.61 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6961  phosphoserine aminotransferase  25.33 
 
 
399 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4686  phosphoserine aminotransferase  25.46 
 
 
385 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0966475  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  25.47 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3625  phosphoserine aminotransferase  25 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0111727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4468  phosphoserine aminotransferase  24.1 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0805419  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3020  phosphoserine aminotransferase  25.4 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1825  phosphoserine aminotransferase  23.47 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  24.93 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1294  phosphoserine aminotransferase  22.67 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303177  normal  0.291609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  24.41 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0295  phosphoserine aminotransferase  23.1 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000953711  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0477  phosphoserine aminotransferase  24.68 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  25.88 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  24.47 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2137  phosphoserine aminotransferase  23.9 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3317  phosphoserine aminotransferase  25.66 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36392  3-phosphoserine transaminase  24.41 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2619  phosphoserine aminotransferase  24.15 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>