More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1532 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 
382 aa  765    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  57.57 
 
 
373 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  58.04 
 
 
370 aa  418  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  56.06 
 
 
371 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  56.49 
 
 
376 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  56.4 
 
 
369 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  55.71 
 
 
376 aa  408  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  56.1 
 
 
377 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  55.56 
 
 
370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  54.93 
 
 
375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  55.83 
 
 
387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  55.47 
 
 
374 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  55.26 
 
 
395 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  56.22 
 
 
375 aa  403  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  56.27 
 
 
374 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  54.03 
 
 
377 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  56.68 
 
 
376 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  54.32 
 
 
376 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  52 
 
 
376 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  58.06 
 
 
374 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  55.59 
 
 
370 aa  398  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  56.95 
 
 
378 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  53.24 
 
 
373 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  52.69 
 
 
374 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  52.28 
 
 
381 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  55.98 
 
 
370 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  53.87 
 
 
375 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  55.98 
 
 
370 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  55.98 
 
 
370 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  51.73 
 
 
379 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  52.55 
 
 
417 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  55.46 
 
 
372 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  52.19 
 
 
378 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  51.63 
 
 
372 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  52.19 
 
 
369 aa  363  3e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  51.05 
 
 
393 aa  362  6e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  53.53 
 
 
385 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  48.94 
 
 
380 aa  333  3e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  42.78 
 
 
373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  30.99 
 
 
383 aa  160  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  28.01 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  26.57 
 
 
361 aa  113  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  27.82 
 
 
363 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  28.03 
 
 
385 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  28.03 
 
 
385 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  26.27 
 
 
346 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  27.62 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  29.07 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4686  phosphoserine aminotransferase  26.58 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0966475  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0009  phosphoserine aminotransferase  27.93 
 
 
385 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2619  phosphoserine aminotransferase  27.56 
 
 
392 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0260  phosphoserine aminotransferase  26.49 
 
 
389 aa  90.9  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  25.72 
 
 
375 aa  90.1  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  27.6 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  26.68 
 
 
410 aa  89.7  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42458  phosphoserine transaminase  26.85 
 
 
409 aa  89.7  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.809086  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3317  phosphoserine aminotransferase  28.04 
 
 
384 aa  89.4  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1332  phosphoserine aminotransferase  26.09 
 
 
371 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0617  phosphoserine aminotransferase  27.62 
 
 
376 aa  89  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  25.89 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3020  phosphoserine aminotransferase  26.93 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  24.79 
 
 
358 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  24.52 
 
 
358 aa  86.7  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  25.7 
 
 
352 aa  86.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4468  phosphoserine aminotransferase  27.18 
 
 
395 aa  86.3  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0805419  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  25.34 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3487  phosphoserine aminotransferase  27.25 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.146301 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  24.78 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  26.09 
 
 
357 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3162  phosphoserine aminotransferase  26.72 
 
 
390 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  24.46 
 
 
374 aa  82  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  26.58 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0295  phosphoserine aminotransferase  24.07 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000953711  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  25.96 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1203  phosphoserine aminotransferase  26.46 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509685  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  26.29 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4790  phosphoserine aminotransferase  26.77 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  26.63 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3193  phosphoserine aminotransferase  26.67 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0477  phosphoserine aminotransferase  25.47 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108745 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  25.68 
 
 
370 aa  79  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  24.45 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1825  phosphoserine aminotransferase  26.37 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  25.82 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  25.48 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1350  phosphoserine aminotransferase  23.43 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0813  phosphoserine aminotransferase  26.93 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1270  phosphoserine aminotransferase  25.99 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1171  phosphoserine aminotransferase  24.74 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861672  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  25.73 
 
 
390 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  24.12 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  25 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  24.38 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  23.69 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  24.44 
 
 
360 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5460  phosphoserine aminotransferase  26.85 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1632  phosphoserine aminotransferase  23.48 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  25.77 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  23.85 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1719  phosphoserine aminotransferase  26.47 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.442694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>