295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2704 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 346 aa  721    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  42.53 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  39.65 
 
 		 352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  31.52 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  30.19 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  30.4 
 
 		 357 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  27.15 
 
 		 370 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  27.3 
 
 		 381 aa  109  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  28.18 
 
 		 395 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  24.51 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  26.26 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  27.17 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  25.49 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  27.25 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  26.27 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  25.92 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  25.5 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  27.17 
 
 		 371 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  26.58 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  26.63 
 
 		 377 aa  97.4  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  27.02 
 
 		 375 aa  96.3  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  25.84 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  25.92 
 
 		 376 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  25.7 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  27.02 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  24.79 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  25 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  27.37 
 
 		 370 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  27.37 
 
 		 370 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  27.37 
 
 		 370 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  25 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  25 
 
 		 362 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  24.23 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  27.01 
 
 		 383 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  25.7 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  23.82 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  25.49 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  25.21 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  24.86 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  25.85 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  25.41 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  24.16 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  23.74 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  24.72 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  21.97 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0295  phosphoserine aminotransferase  26.77 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000953711  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  22.44 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  23.2 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  24.51 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  24.92 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  24.51 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1332  phosphoserine aminotransferase  26.3 
 
 		 371 aa  75.9  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  22.25 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  26.35 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  24.93 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  27.13 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  25.17 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  25.49 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  25.21 
 
 		 357 aa  72  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  21.35 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  23.33 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  21.58 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  23.53 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  23.86 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  26.95 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  22.57 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  27.1 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  22.75 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  25.75 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1171  phosphoserine aminotransferase  24.81 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  22.29 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  24.27 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  23.41 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  24.34 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0870  aminotransferase, class V  23.05 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  22.69 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0855  aminotransferase class V  22.03 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  22.8 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  28.21 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  25 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  22.63 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  22.86 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  21.71 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1770  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  24.1 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  24.36 
 
 		 400 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2063  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  22.99 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.302236  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  25.23 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1789  aminotransferase class V  21.65 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.530358  normal  0.630477 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2028  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  24.1 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1053  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  24.1 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0778  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  23.82 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0689  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  23.82 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  24.2 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0760  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  24.1 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  24.61 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  24.59 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  25.58 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  23.64 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  21.64 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  26.44 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>