More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1073 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  100 
 
 		 363 aa  763    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  61.43 
 
 		 357 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  48.63 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  31.39 
 
 		 338 aa  176  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  30.4 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  30.19 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  29.52 
 
 		 357 aa  122  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  28.3 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  29.21 
 
 		 357 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  24.73 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  27.93 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  24.73 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  27.42 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  28.04 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  27.57 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  27.3 
 
 		 356 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  27.73 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  28.57 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  26.54 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  26.88 
 
 		 373 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  26.74 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  27.47 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  29.18 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  26.61 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  26.9 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  27.46 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  26.85 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  27.82 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  27.02 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  28.68 
 
 		 383 aa  102  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  26.58 
 
 		 371 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  26.67 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  26.22 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  26.29 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  26.29 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  26.29 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  27.12 
 
 		 377 aa  99.4  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  25.93 
 
 		 370 aa  99.4  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  26.56 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  26.33 
 
 		 374 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  22.13 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  27.07 
 
 		 369 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  26.16 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  26.09 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  26.1 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  26.71 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  24.37 
 
 		 372 aa  90.5  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  25.9 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  25.48 
 
 		 380 aa  89.4  9e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  25.59 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  25.82 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  26.59 
 
 		 372 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  25.14 
 
 		 375 aa  86.3  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  25.42 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  25.21 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  27.75 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1464  phosphoserine aminotransferase  27.82 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  27.3 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  24.93 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  24.79 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  27.37 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  24.93 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  27.53 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  28.14 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  29.78 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  25.27 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3281  phosphoserine aminotransferase  26.92 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0372795  normal  0.449595 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  25.15 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  25.79 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  24.93 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  25.39 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  26.97 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2443  phosphoserine aminotransferase  25.26 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  24.93 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  26.95 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  30.19 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  26.09 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  25.28 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2465  phosphoserine aminotransferase  26.6 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.394582 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  27.96 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1395  phosphoserine aminotransferase  26.6 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.13819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  25.26 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  25.55 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  28.38 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  29 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1489  phosphoserine aminotransferase  27.91 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0105187  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  28.37 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  28.02 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  28.02 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  24.23 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  23.89 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  31.41 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  23.91 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  29.31 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  24.55 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  24.33 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44075  predicted protein  27.52 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  29.31 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  23.94 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3120  phosphoserine aminotransferase  24.29 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>