More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5113 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  100 
 
 		 352 aa  730    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  55.14 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  39.65 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  34.77 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  35.8 
 
 		 361 aa  183  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  30.4 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  31.73 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  31.36 
 
 		 357 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  27.97 
 
 		 360 aa  116  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  28.9 
 
 		 357 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  30.48 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  29.09 
 
 		 370 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  28.9 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  29.1 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  28.41 
 
 		 377 aa  109  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  28.73 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  29.12 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  28.09 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  29.01 
 
 		 358 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  29.53 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  27.84 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  27.25 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  26.89 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  29.33 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  29.05 
 
 		 374 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  27.27 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  28.21 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  28.05 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  26.82 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  28.46 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  26.84 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  26.36 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  27.82 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  28.33 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  27.12 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  24.18 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  29.41 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  27.95 
 
 		 362 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  28.05 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  28.05 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  28.05 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  27.02 
 
 		 371 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  27.64 
 
 		 370 aa  89.4  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  26.33 
 
 		 373 aa  89.4  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  26.63 
 
 		 377 aa  88.6  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  29.39 
 
 		 376 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  26.67 
 
 		 380 aa  89  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  28.53 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  28.73 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  26.5 
 
 		 378 aa  87  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  25.7 
 
 		 382 aa  86.3  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  28.13 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  27.86 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  28.42 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  27.3 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  26.36 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  25.41 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  24.72 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  24.23 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  28.62 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  23.4 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  25.47 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  30.14 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  27.32 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  24.8 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  25.69 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1702  aminotransferase class V  28.08 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  27.46 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  33.51 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  26.27 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2533  aminotransferase class V  25.07 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  25.41 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  25 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  25 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  24.72 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  24.45 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  26.9 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  24.42 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0870  aminotransferase, class V  30.45 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  25.79 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  26.3 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  27.62 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  25.22 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2203  Serine--pyruvate transaminase  25.7 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  24.29 
 
 		 415 aa  72.8  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  26.1 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  25.53 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  24.53 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  26.84 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  26.59 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  24.34 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  25.81 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  26.26 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  28.7 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  27.39 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  26.95 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42458  phosphoserine transaminase  23.71 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.809086  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  24.33 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3625  phosphoserine aminotransferase  28.23 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0111727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  23.3 
 
 		 395 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>