More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0020 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  100 
 
 		 373 aa  766    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  45.8 
 
 		 373 aa  320  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  44.54 
 
 		 370 aa  311  7.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  44.84 
 
 		 373 aa  311  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  46.47 
 
 		 377 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  45.92 
 
 		 369 aa  302  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  44.02 
 
 		 376 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  44.81 
 
 		 370 aa  295  6e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  42.55 
 
 		 377 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  42.16 
 
 		 370 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  44.72 
 
 		 375 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  42.12 
 
 		 376 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  41.69 
 
 		 376 aa  289  7e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  44.84 
 
 		 374 aa  288  8e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  41.94 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  42.05 
 
 		 374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  42.08 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  43.9 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  43.05 
 
 		 378 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  44.29 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  41.3 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  44.86 
 
 		 374 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  42.78 
 
 		 382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  42.39 
 
 		 375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  43.43 
 
 		 385 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  40.49 
 
 		 375 aa  270  4e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  40.92 
 
 		 387 aa  269  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  41.3 
 
 		 417 aa  268  8.999999999999999e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  39.67 
 
 		 395 aa  266  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  40.97 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  42.62 
 
 		 369 aa  260  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  39.57 
 
 		 376 aa  259  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  39.67 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  39.67 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  39.67 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  40.92 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  40.9 
 
 		 379 aa  251  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  40.6 
 
 		 378 aa  249  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  36.94 
 
 		 380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  30.39 
 
 		 383 aa  139  7.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  28.41 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  28.7 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  28.99 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  24.51 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  28.11 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  27.81 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  27.41 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  25.87 
 
 		 362 aa  96.7  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  28.37 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  27.65 
 
 		 357 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  26.86 
 
 		 360 aa  93.6  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  27.41 
 
 		 358 aa  93.2  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  27.15 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  27.65 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  27.46 
 
 		 357 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  26.71 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4468  phosphoserine aminotransferase  26.72 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0805419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1203  phosphoserine aminotransferase  25.6 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  26.33 
 
 		 352 aa  89.4  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  27.75 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  26.29 
 
 		 391 aa  88.6  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  27.75 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  26.28 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  23.29 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  25.07 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6799  phosphoserine aminotransferase  27.12 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1068  phosphoserine aminotransferase  25.54 
 
 		 362 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0934537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0617  phosphoserine aminotransferase  26.56 
 
 		 376 aa  86.3  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.890804 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00911  phosphoserine aminotransferase  25.81 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.500761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00918  hypothetical protein  25.81 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2214  phosphoserine aminotransferase  25.81 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.183325  normal  0.123491 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1013  phosphoserine aminotransferase  25.81 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000154945  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2421  phosphoserine aminotransferase  25.81 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000598679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2689  phosphoserine aminotransferase  25.81 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00904863  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  25.55 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2736  phosphoserine aminotransferase  25.81 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  22.64 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1004  phosphoserine aminotransferase  25.54 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000735422  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  25.33 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0009  phosphoserine aminotransferase  26.53 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470966 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  22.8 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  23.55 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  24.2 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2000  phosphoserine aminotransferase  26.26 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.572206  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  22.53 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  24.71 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1732  phosphoserine aminotransferase  24.06 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1857  phosphoserine aminotransferase  24.66 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.729123  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  27.19 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0611  phosphoserine aminotransferase  22.83 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0735  phosphoserine aminotransferase  23.18 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000198961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3079  phosphoserine aminotransferase  22.8 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3321  phosphoserine aminotransferase  22.8 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  24.2 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  22.53 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  26.6 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  24.86 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1314  phosphoserine aminotransferase  26.36 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1825  phosphoserine aminotransferase  26.17 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3120  phosphoserine aminotransferase  24.67 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>