239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1489 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1489  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 
364 aa  750    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0105187  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0619  phosphoserine aminotransferase  61.1 
 
 
365 aa  481  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  54.55 
 
 
360 aa  395  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2987  phosphoserine aminotransferase  54.67 
 
 
360 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  53.85 
 
 
360 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  53.3 
 
 
360 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  53.57 
 
 
360 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  53.57 
 
 
360 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  52.75 
 
 
360 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  53.3 
 
 
360 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  52.34 
 
 
360 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  53.02 
 
 
360 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3079  phosphoserine aminotransferase  53.02 
 
 
360 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3321  phosphoserine aminotransferase  53.02 
 
 
360 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  51.8 
 
 
360 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  53.01 
 
 
359 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  50 
 
 
362 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  51.1 
 
 
359 aa  369  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  51.37 
 
 
361 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  50.96 
 
 
387 aa  364  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3221  phosphoserine aminotransferase  51.79 
 
 
361 aa  364  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  51.94 
 
 
360 aa  362  8e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  51.52 
 
 
361 aa  360  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  52.07 
 
 
360 aa  360  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  50.28 
 
 
360 aa  358  7e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  50.68 
 
 
362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  50.68 
 
 
362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02623  phosphoserine aminotransferase  50.96 
 
 
367 aa  355  7.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0735  phosphoserine aminotransferase  49.32 
 
 
364 aa  354  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000198961  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  50.41 
 
 
361 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  49.72 
 
 
360 aa  352  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 
359 aa  352  4e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  48.89 
 
 
360 aa  352  5e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  49.17 
 
 
377 aa  351  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2332  phosphoserine aminotransferase  49.45 
 
 
361 aa  349  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003748  phosphoserine aminotransferase  51.25 
 
 
364 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000403909  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  49.86 
 
 
362 aa  346  4e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0638  phosphoserine aminotransferase  49.72 
 
 
360 aa  345  6e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1454  phosphoserine aminotransferase  49.03 
 
 
362 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  47.38 
 
 
359 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0611  phosphoserine aminotransferase  47.67 
 
 
358 aa  338  8e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  48.89 
 
 
360 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  48.06 
 
 
373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2083  phosphoserine aminotransferase  48.21 
 
 
360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  48.48 
 
 
361 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2214  phosphoserine aminotransferase  48.08 
 
 
361 aa  334  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.277 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  47.5 
 
 
369 aa  333  3e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2041  phosphoserine aminotransferase  50 
 
 
360 aa  333  4e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3363  phosphoserine aminotransferase  48.08 
 
 
361 aa  332  7.000000000000001e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  46.99 
 
 
381 aa  331  1e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  49.04 
 
 
361 aa  330  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  49.18 
 
 
361 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  47.79 
 
 
361 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  49.72 
 
 
361 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  47.37 
 
 
360 aa  329  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  47.79 
 
 
395 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0903  phosphoserine aminotransferase  46.59 
 
 
378 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2302  phosphoserine aminotransferase  47.96 
 
 
364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.589874  hitchhiker  0.000000030251 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  48.63 
 
 
361 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  48.62 
 
 
361 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  48.62 
 
 
361 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  47.79 
 
 
363 aa  324  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1115  phosphoserine aminotransferase  46.67 
 
 
362 aa  324  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.27291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2540  phosphoserine aminotransferase  46.83 
 
 
361 aa  322  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455506  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1369  phosphoserine aminotransferase  45.48 
 
 
362 aa  321  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2173  phosphoserine aminotransferase  48.08 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  46.99 
 
 
363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1719  phosphoserine aminotransferase  45.43 
 
 
360 aa  320  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1732  phosphoserine aminotransferase  48.62 
 
 
364 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.443235  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  46.85 
 
 
354 aa  318  9e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1373  phosphoserine aminotransferase  44.23 
 
 
362 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0728  phosphoserine aminotransferase  48.76 
 
 
379 aa  318  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000226259  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2069  phosphoserine aminotransferase  47.81 
 
 
363 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311647  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0773  phosphoserine aminotransferase  45.23 
 
 
378 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431862  decreased coverage  0.00259178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0844  phosphoserine aminotransferase  44.96 
 
 
378 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.259314  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0976  phosphoserine aminotransferase  44.14 
 
 
360 aa  315  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33803  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  46.15 
 
 
365 aa  314  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1634  phosphoserine aminotransferase  45.18 
 
 
360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12357  predicted protein  46.58 
 
 
394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169231  normal  0.290006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2307  phosphoserine aminotransferase  45.48 
 
 
364 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0347378  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1947  phosphoserine aminotransferase  45.28 
 
 
363 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0433  phosphoserine aminotransferase  45.18 
 
 
360 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2998  phosphoserine aminotransferase  45.18 
 
 
360 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2129  phosphoserine aminotransferase  46.13 
 
 
363 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2576  phosphoserine aminotransferase  45.18 
 
 
360 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0951  phosphoserine aminotransferase  45.18 
 
 
360 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2886  phosphoserine aminotransferase  45.18 
 
 
360 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2949  phosphoserine aminotransferase  45.18 
 
 
360 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0197  phosphoserine aminotransferase  45.18 
 
 
360 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2576  phosphoserine aminotransferase  45.5 
 
 
383 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0448308  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  43.6 
 
 
360 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2262  phosphoserine aminotransferase  45.21 
 
 
360 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.022425  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0740  phosphoserine aminotransferase  43.21 
 
 
360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1464  phosphoserine aminotransferase  47.43 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1001  phosphoserine aminotransferase  43.99 
 
 
360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0563  phosphoserine aminotransferase  43.99 
 
 
360 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1042  phosphoserine aminotransferase  43.99 
 
 
360 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943212  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0922  phosphoserine aminotransferase  44.54 
 
 
360 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0715  phosphoserine aminotransferase  44.2 
 
 
387 aa  305  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1706  phosphoserine aminotransferase  46.83 
 
 
361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000174531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>