254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3383 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 387 aa  801    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  75.49 
 
 		 362 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  75 
 
 		 359 aa  580  1e-164  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  72.78 
 
 		 360 aa  557  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  57.78 
 
 		 360 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  58.13 
 
 		 362 aa  434  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  57.78 
 
 		 360 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  59.61 
 
 		 360 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  58.61 
 
 		 359 aa  428  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  56.86 
 
 		 359 aa  421  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0735  phosphoserine aminotransferase  56.95 
 
 		 364 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000198961  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2987  phosphoserine aminotransferase  55.83 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  55.96 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  55.28 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  55.12 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  54.17 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  54.02 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  53.97 
 
 		 365 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  55 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  54.72 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0903  phosphoserine aminotransferase  51.77 
 
 		 378 aa  401  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  55.12 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  54.85 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1744  phosphoserine aminotransferase  54.44 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  52.91 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  54.17 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  53.44 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  54.44 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2576  phosphoserine aminotransferase  51.64 
 
 		 383 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0448308  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0844  phosphoserine aminotransferase  50.41 
 
 		 378 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.259314  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3079  phosphoserine aminotransferase  54.29 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3321  phosphoserine aminotransferase  54.29 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12357  predicted protein  56.08 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169231  normal  0.290006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  53.48 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  55.37 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  53.76 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  51.18 
 
 		 395 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  53.07 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0976  phosphoserine aminotransferase  52.08 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0773  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 		 378 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431862  decreased coverage  0.00259178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  54.04 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  52.79 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  53.2 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0715  phosphoserine aminotransferase  50.54 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  52.38 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  52.51 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  53.04 
 
 		 361 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  52.03 
 
 		 381 aa  388  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  51.39 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0740  phosphoserine aminotransferase  51.11 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  52.65 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0922  phosphoserine aminotransferase  51.52 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  50.84 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2332  phosphoserine aminotransferase  51.25 
 
 		 361 aa  381  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1001  phosphoserine aminotransferase  50.83 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4155  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1793  phosphoserine aminotransferase  49.05 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00029635 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0918  phosphoserine aminotransferase  51.25 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3281  phosphoserine aminotransferase  47.03 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0372795  normal  0.449595 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  50.84 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  51.96 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1719  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1454  phosphoserine aminotransferase  51.1 
 
 		 362 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2041  phosphoserine aminotransferase  51.79 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0563  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  51.11 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2262  phosphoserine aminotransferase  50.83 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.022425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1042  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943212  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3221  phosphoserine aminotransferase  52.78 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978624  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2792  phosphoserine aminotransferase  48.78 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159543 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0433  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2998  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1634  phosphoserine aminotransferase  50.28 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4720  phosphoserine aminotransferase  47.57 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2576  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0951  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2886  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2949  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0197  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1618  phosphoserine aminotransferase  49.05 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1570  phosphoserine aminotransferase  46.9 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  50.69 
 
 		 369 aa  375  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2173  phosphoserine aminotransferase  51.12 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1395  phosphoserine aminotransferase  47.3 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.13819  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1115  phosphoserine aminotransferase  50.42 
 
 		 362 aa  371  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.27291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2465  phosphoserine aminotransferase  47.3 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.394582 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0638  phosphoserine aminotransferase  49.72 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1375  phosphoserine aminotransferase  52.84 
 
 		 335 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0619  phosphoserine aminotransferase  51.78 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3120  phosphoserine aminotransferase  47.03 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  49.86 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1359  phosphoserine aminotransferase  52.68 
 
 		 335 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416954  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0494  phosphoserine aminotransferase  51.67 
 
 		 365 aa  368  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000536248  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1314  phosphoserine aminotransferase  51.11 
 
 		 365 aa  365  1e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.177266  hitchhiker  1.24275e-22 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1373  phosphoserine aminotransferase  49.16 
 
 		 362 aa  364  1e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1369  phosphoserine aminotransferase  48.88 
 
 		 362 aa  364  1e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1489  phosphoserine aminotransferase  50.96 
 
 		 364 aa  364  1e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0105187  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1952  phosphoserine aminotransferase  48.75 
 
 		 361 aa  365  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132565  normal  0.221231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>