170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2619 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1687  phosphoserine aminotransferase  81.33 
 
 		 391 aa  652    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3193  phosphoserine aminotransferase  86.13 
 
 		 392 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3596  phosphoserine aminotransferase  80.36 
 
 		 392 aa  651    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3162  phosphoserine aminotransferase  81.96 
 
 		 390 aa  654    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3487  phosphoserine aminotransferase  85.97 
 
 		 392 aa  696    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.146301 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1631  phosphoserine aminotransferase  80.82 
 
 		 391 aa  650    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2619  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 392 aa  793    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1228  phosphoserine aminotransferase  81.59 
 
 		 391 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.858979  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4790  phosphoserine aminotransferase  73.13 
 
 		 390 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1203  phosphoserine aminotransferase  75.7 
 
 		 391 aa  584  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  72.61 
 
 		 390 aa  579  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1825  phosphoserine aminotransferase  72.61 
 
 		 390 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1270  phosphoserine aminotransferase  73.25 
 
 		 390 aa  574  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0271  phosphoserine aminotransferase  71.2 
 
 		 384 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2137  phosphoserine aminotransferase  72.54 
 
 		 390 aa  576  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2969  phosphoserine aminotransferase  71.32 
 
 		 390 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1314  phosphoserine aminotransferase  72.02 
 
 		 390 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3906  phosphoserine aminotransferase  71.76 
 
 		 389 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4107  phosphoserine aminotransferase  72.09 
 
 		 390 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  69.57 
 
 		 390 aa  552  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0009  phosphoserine aminotransferase  72.51 
 
 		 385 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6799  phosphoserine aminotransferase  71.13 
 
 		 390 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6395  phosphoserine aminotransferase  71.65 
 
 		 390 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  71.73 
 
 		 385 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  71.99 
 
 		 385 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4468  phosphoserine aminotransferase  67.94 
 
 		 395 aa  537  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0805419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0813  phosphoserine aminotransferase  71.43 
 
 		 384 aa  531  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0260  phosphoserine aminotransferase  68.67 
 
 		 389 aa  525  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3625  phosphoserine aminotransferase  67.01 
 
 		 389 aa  521  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0111727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3317  phosphoserine aminotransferase  71.24 
 
 		 384 aa  519  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1171  phosphoserine aminotransferase  63.9 
 
 		 392 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1332  phosphoserine aminotransferase  65 
 
 		 371 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3020  phosphoserine aminotransferase  68.5 
 
 		 381 aa  512  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4686  phosphoserine aminotransferase  65.8 
 
 		 385 aa  512  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0966475  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  63.21 
 
 		 391 aa  509  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6961  phosphoserine aminotransferase  63.97 
 
 		 399 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0670  phosphoserine aminotransferase  65.7 
 
 		 391 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.786402  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5460  phosphoserine aminotransferase  63.38 
 
 		 385 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0638  phosphoserine aminotransferase  64.64 
 
 		 391 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612941  normal  0.204061 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  64.77 
 
 		 396 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1294  phosphoserine aminotransferase  61.74 
 
 		 370 aa  488  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303177  normal  0.291609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0659  phosphoserine aminotransferase  65.17 
 
 		 391 aa  490  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.381901 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1104  phosphoserine aminotransferase  65.87 
 
 		 384 aa  485  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  63.09 
 
 		 379 aa  484  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0295  phosphoserine aminotransferase  60.53 
 
 		 372 aa  481  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000953711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  60.89 
 
 		 374 aa  477  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0617  phosphoserine aminotransferase  61.82 
 
 		 376 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0477  phosphoserine aminotransferase  61.32 
 
 		 393 aa  461  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108745 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42458  phosphoserine transaminase  60.36 
 
 		 409 aa  453  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.809086  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  46.98 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  26.41 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  28.69 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  26.55 
 
 		 370 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  26.51 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  25.86 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  27.56 
 
 		 382 aa  90.5  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  25.54 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  25.98 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  27.73 
 
 		 378 aa  86.3  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  27.25 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  25.38 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  26.09 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  26.49 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  26.49 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  26.49 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  24.27 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  25.59 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  26.68 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  26.15 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  26.22 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  25.27 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  24.19 
 
 		 373 aa  76.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  24.27 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  24.14 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  23.3 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  25.78 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  24.33 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  26.75 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  24.15 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  25.96 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  23.85 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  24.46 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  24.67 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  23.16 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  24.42 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  25.4 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  22.51 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  22.71 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  24.8 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1278  phosphoserine aminotransferase  23.84 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1719  phosphoserine aminotransferase  25.23 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.442694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2063  phosphoserine aminotransferase  22.65 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.234142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2403  phosphoserine aminotransferase  22.65 
 
 		 363 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.107805  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2286  phosphoserine aminotransferase  22.65 
 
 		 363 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000800198  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  28.44 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0639  phosphoserine aminotransferase  22.87 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2059  phosphoserine aminotransferase  22.33 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0529016  unclonable  0.00000000000274518 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08691  phosphoserine aminotransferase  23.08 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  26.89 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  25.51 
 
 		 365 aa  53.9  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>