240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2286 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2410  phosphoserine aminotransferase  91.16 
 
 		 367 aa  694    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2059  phosphoserine aminotransferase  96.97 
 
 		 363 aa  736    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0529016  unclonable  0.00000000000274518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2069  phosphoserine aminotransferase  93.65 
 
 		 363 aa  713    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000307219  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2286  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 363 aa  753    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000800198  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1920  phosphoserine aminotransferase  91.74 
 
 		 363 aa  700    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00965708  hitchhiker  0.00000000132125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2058  phosphoserine aminotransferase  91.46 
 
 		 363 aa  697    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00301752  unclonable  0.0000270653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1973  phosphoserine aminotransferase  91.46 
 
 		 363 aa  699    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000290161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2063  phosphoserine aminotransferase  98.07 
 
 		 363 aa  740    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.234142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2403  phosphoserine aminotransferase  98.35 
 
 		 363 aa  742    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.107805  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1947  phosphoserine aminotransferase  81.82 
 
 		 363 aa  629  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2129  phosphoserine aminotransferase  81.27 
 
 		 363 aa  620  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2069  phosphoserine aminotransferase  76.31 
 
 		 363 aa  592  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311647  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1950  phosphoserine aminotransferase  75.69 
 
 		 364 aa  589  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.471166  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1732  phosphoserine aminotransferase  75.76 
 
 		 364 aa  588  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.443235  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2307  phosphoserine aminotransferase  75.69 
 
 		 364 aa  584  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0347378  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2302  phosphoserine aminotransferase  73.55 
 
 		 364 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.589874  hitchhiker  0.000000030251 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2332  phosphoserine aminotransferase  57.58 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02623  phosphoserine aminotransferase  57.5 
 
 		 367 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  57.26 
 
 		 361 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00911  phosphoserine aminotransferase  56.59 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.500761  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2736  phosphoserine aminotransferase  56.59 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00918  hypothetical protein  56.59 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2689  phosphoserine aminotransferase  56.59 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00904863  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2214  phosphoserine aminotransferase  56.59 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.183325  normal  0.123491 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1013  phosphoserine aminotransferase  56.59 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000154945  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1068  phosphoserine aminotransferase  56.32 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0934537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2041  phosphoserine aminotransferase  55.92 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2421  phosphoserine aminotransferase  56.59 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000598679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1004  phosphoserine aminotransferase  56.32 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000735422  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1732  phosphoserine aminotransferase  55.65 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003748  phosphoserine aminotransferase  56.67 
 
 		 364 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000403909  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2342  phosphoserine aminotransferase  55.1 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0172943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1427  phosphoserine aminotransferase  54.95 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2240  phosphoserine aminotransferase  55.1 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0005461  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1041  phosphoserine aminotransferase  55.34 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147052  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1090  phosphoserine aminotransferase  55.34 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.988584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1010  phosphoserine aminotransferase  55.07 
 
 		 362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1075  phosphoserine aminotransferase  55.34 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25346 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1115  phosphoserine aminotransferase  55.07 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.27291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0982  phosphoserine aminotransferase  55.34 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0279153  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2671  phosphoserine aminotransferase  53.72 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.146724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1952  phosphoserine aminotransferase  53.44 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132565  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2583  phosphoserine aminotransferase  53.72 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00074187  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2000  phosphoserine aminotransferase  53.99 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.572206  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1706  phosphoserine aminotransferase  54.12 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000174531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0728  phosphoserine aminotransferase  54.44 
 
 		 379 aa  388  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000226259  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2078  phosphoserine aminotransferase  51.68 
 
 		 361 aa  384  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  49.73 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0611  phosphoserine aminotransferase  49.86 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  50.4 
 
 		 360 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  50.83 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  51.25 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  51.77 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  51.67 
 
 		 369 aa  368  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0252  phosphoserine aminotransferase  51.07 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  49.73 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  50.95 
 
 		 359 aa  366  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  49.19 
 
 		 362 aa  364  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  48.53 
 
 		 360 aa  364  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  51.67 
 
 		 373 aa  363  3e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  49.32 
 
 		 360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  48.91 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  48.48 
 
 		 354 aa  353  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  49.45 
 
 		 361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  47.11 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  48.07 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  46.69 
 
 		 361 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  47.24 
 
 		 361 aa  349  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  47.12 
 
 		 360 aa  349  5e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  48.64 
 
 		 363 aa  348  7e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  46.96 
 
 		 361 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  47.21 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  46.83 
 
 		 363 aa  342  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  47.31 
 
 		 365 aa  342  8e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1538  phosphoserine aminotransferase  47.12 
 
 		 360 aa  342  8e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0905864  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  47.8 
 
 		 362 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  47.8 
 
 		 362 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0639  phosphoserine aminotransferase  46.85 
 
 		 360 aa  339  5e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  45.86 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2540  phosphoserine aminotransferase  46.72 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455506  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  45.86 
 
 		 361 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  44.93 
 
 		 360 aa  335  9e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0740  phosphoserine aminotransferase  45.4 
 
 		 360 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  45.95 
 
 		 387 aa  333  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  47.68 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0976  phosphoserine aminotransferase  43.45 
 
 		 360 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  43.18 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1634  phosphoserine aminotransferase  44.32 
 
 		 360 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  44.17 
 
 		 359 aa  322  8e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1498  phosphoserine aminotransferase  46.56 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0619  phosphoserine aminotransferase  46.74 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  43.21 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2262  phosphoserine aminotransferase  44.32 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.022425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2998  phosphoserine aminotransferase  44.54 
 
 		 360 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0951  phosphoserine aminotransferase  44.54 
 
 		 360 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2886  phosphoserine aminotransferase  44.54 
 
 		 360 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2949  phosphoserine aminotransferase  44.54 
 
 		 360 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0197  phosphoserine aminotransferase  44.54 
 
 		 360 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>