234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1036 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 373 aa  774    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  95.17 
 
 		 369 aa  731    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  74.4 
 
 		 381 aa  587  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  62.53 
 
 		 361 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  63.36 
 
 		 361 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  62.26 
 
 		 361 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  61.43 
 
 		 361 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  61.16 
 
 		 395 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  61.71 
 
 		 361 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  60.33 
 
 		 363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  59.23 
 
 		 360 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  59.5 
 
 		 360 aa  441  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  60.22 
 
 		 359 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  59.34 
 
 		 361 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  59.5 
 
 		 361 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  59.23 
 
 		 361 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  58.5 
 
 		 359 aa  431  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  58.89 
 
 		 360 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2332  phosphoserine aminotransferase  59.17 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  56.94 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  58.13 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  58.52 
 
 		 361 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  58.29 
 
 		 354 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  57.34 
 
 		 359 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1375  phosphoserine aminotransferase  60.29 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  54.27 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1359  phosphoserine aminotransferase  59.41 
 
 		 335 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416954  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1090  phosphoserine aminotransferase  56.79 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.988584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1041  phosphoserine aminotransferase  56.79 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147052  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1427  phosphoserine aminotransferase  56.79 
 
 		 362 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1075  phosphoserine aminotransferase  56.79 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25346 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1010  phosphoserine aminotransferase  56.79 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0982  phosphoserine aminotransferase  56.79 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0279153  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2736  phosphoserine aminotransferase  55.96 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  56.32 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1068  phosphoserine aminotransferase  55.68 
 
 		 362 aa  408  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0934537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1115  phosphoserine aminotransferase  56.87 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.27291 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02623  phosphoserine aminotransferase  56.55 
 
 		 367 aa  408  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00911  phosphoserine aminotransferase  55.68 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.500761  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1013  phosphoserine aminotransferase  55.68 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000154945  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2689  phosphoserine aminotransferase  55.68 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00904863  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2421  phosphoserine aminotransferase  55.68 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000598679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1004  phosphoserine aminotransferase  55.68 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000735422  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00918  hypothetical protein  55.68 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2214  phosphoserine aminotransferase  55.68 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.183325  normal  0.123491 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003748  phosphoserine aminotransferase  56.55 
 
 		 364 aa  403  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000403909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  54.44 
 
 		 362 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  53.87 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  54.44 
 
 		 362 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2041  phosphoserine aminotransferase  56.2 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1706  phosphoserine aminotransferase  55.83 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000174531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1952  phosphoserine aminotransferase  55.12 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132565  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2240  phosphoserine aminotransferase  54.17 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0005461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2583  phosphoserine aminotransferase  54.17 
 
 		 361 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00074187  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0728  phosphoserine aminotransferase  55.71 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000226259  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  55.83 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2342  phosphoserine aminotransferase  54.44 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0172943  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  53.31 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1732  phosphoserine aminotransferase  54.57 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  54.77 
 
 		 365 aa  391  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2671  phosphoserine aminotransferase  54.17 
 
 		 361 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.146724  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2000  phosphoserine aminotransferase  54.57 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.572206  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  51.38 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2987  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575995  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  54.25 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  51.37 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2262  phosphoserine aminotransferase  52.75 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.022425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0740  phosphoserine aminotransferase  51.92 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  50.28 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0976  phosphoserine aminotransferase  51.1 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  53.17 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2078  phosphoserine aminotransferase  53.19 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  50 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  50 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  50 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0922  phosphoserine aminotransferase  51.65 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1947  phosphoserine aminotransferase  53.44 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  50.28 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0918  phosphoserine aminotransferase  52.05 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  49.72 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2792  phosphoserine aminotransferase  50.54 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159543 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  50.28 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0903  phosphoserine aminotransferase  51.08 
 
 		 378 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1618  phosphoserine aminotransferase  50.82 
 
 		 377 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2576  phosphoserine aminotransferase  51.35 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0448308  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4155  phosphoserine aminotransferase  51.1 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1634  phosphoserine aminotransferase  52.6 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  49.72 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1793  phosphoserine aminotransferase  49.73 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00029635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4720  phosphoserine aminotransferase  49.19 
 
 		 369 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3079  phosphoserine aminotransferase  49.72 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2998  phosphoserine aminotransferase  52.33 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0563  phosphoserine aminotransferase  50.55 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1920  phosphoserine aminotransferase  53.61 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00965708  hitchhiker  0.00000000132125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3281  phosphoserine aminotransferase  48.39 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0372795  normal  0.449595 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2576  phosphoserine aminotransferase  52.33 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0951  phosphoserine aminotransferase  52.33 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2886  phosphoserine aminotransferase  52.33 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2949  phosphoserine aminotransferase  52.33 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0197  phosphoserine aminotransferase  52.33 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>