240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1359 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  97.01 
 
 		 361 aa  674    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  95.21 
 
 		 363 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1359  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 335 aa  688    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416954  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  97.31 
 
 		 395 aa  676    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1375  phosphoserine aminotransferase  96.42 
 
 		 335 aa  669    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  88.36 
 
 		 361 aa  620  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  87.46 
 
 		 361 aa  619  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  87.16 
 
 		 361 aa  616  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  87.16 
 
 		 361 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  79.4 
 
 		 361 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  78.81 
 
 		 361 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  68.36 
 
 		 360 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  63.88 
 
 		 360 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  62.09 
 
 		 360 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  61.19 
 
 		 359 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  62.69 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  62.99 
 
 		 359 aa  435  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  59.64 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  61.24 
 
 		 363 aa  433  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  61.19 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  60.42 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  59.4 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  59.23 
 
 		 361 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  58.51 
 
 		 360 aa  418  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  58.51 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  59.41 
 
 		 373 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  58.31 
 
 		 381 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  58.82 
 
 		 369 aa  414  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1952  phosphoserine aminotransferase  57.78 
 
 		 361 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132565  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  56.12 
 
 		 354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  57.74 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  56.08 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  57.74 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2671  phosphoserine aminotransferase  56.89 
 
 		 361 aa  404  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.146724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2583  phosphoserine aminotransferase  56.89 
 
 		 361 aa  404  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00074187  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00911  phosphoserine aminotransferase  58.81 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.500761  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2736  phosphoserine aminotransferase  58.81 
 
 		 362 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2689  phosphoserine aminotransferase  58.81 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00904863  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2332  phosphoserine aminotransferase  57.91 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1013  phosphoserine aminotransferase  58.81 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000154945  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00918  hypothetical protein  58.81 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1706  phosphoserine aminotransferase  57.44 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000174531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2421  phosphoserine aminotransferase  58.46 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000598679  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  57.94 
 
 		 365 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1004  phosphoserine aminotransferase  58.16 
 
 		 362 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000735422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2214  phosphoserine aminotransferase  58.81 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.183325  normal  0.123491 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1068  phosphoserine aminotransferase  58.81 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0934537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2240  phosphoserine aminotransferase  57.44 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0005461  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1115  phosphoserine aminotransferase  57.57 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.27291 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2342  phosphoserine aminotransferase  58.04 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0172943  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1041  phosphoserine aminotransferase  57.61 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147052  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1075  phosphoserine aminotransferase  57.61 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25346 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1010  phosphoserine aminotransferase  57.27 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0982  phosphoserine aminotransferase  57.61 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0279153  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003748  phosphoserine aminotransferase  57.74 
 
 		 364 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000403909  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1090  phosphoserine aminotransferase  57.61 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.988584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2000  phosphoserine aminotransferase  58.33 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.572206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02623  phosphoserine aminotransferase  56.85 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1427  phosphoserine aminotransferase  56.08 
 
 		 362 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  56.97 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1732  phosphoserine aminotransferase  56.55 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4155  phosphoserine aminotransferase  56.16 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0976  phosphoserine aminotransferase  54.35 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0740  phosphoserine aminotransferase  55.56 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  54.35 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1001  phosphoserine aminotransferase  56.16 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2041  phosphoserine aminotransferase  55.65 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  57.01 
 
 		 361 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0563  phosphoserine aminotransferase  56.16 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0918  phosphoserine aminotransferase  55.56 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1042  phosphoserine aminotransferase  56.16 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943212  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0922  phosphoserine aminotransferase  55.86 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1570  phosphoserine aminotransferase  54.39 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0728  phosphoserine aminotransferase  56.55 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000226259  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2262  phosphoserine aminotransferase  55.26 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.022425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3281  phosphoserine aminotransferase  53.51 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0372795  normal  0.449595 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0903  phosphoserine aminotransferase  53.69 
 
 		 378 aa  371  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2576  phosphoserine aminotransferase  54.28 
 
 		 383 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0448308  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1634  phosphoserine aminotransferase  54.35 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1793  phosphoserine aminotransferase  51.16 
 
 		 368 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00029635 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1538  phosphoserine aminotransferase  52.08 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0905864  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0639  phosphoserine aminotransferase  51.79 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0433  phosphoserine aminotransferase  54.35 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4720  phosphoserine aminotransferase  52.33 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2998  phosphoserine aminotransferase  54.35 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2576  phosphoserine aminotransferase  54.35 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0951  phosphoserine aminotransferase  54.35 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2886  phosphoserine aminotransferase  54.35 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2949  phosphoserine aminotransferase  54.35 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0197  phosphoserine aminotransferase  54.35 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1618  phosphoserine aminotransferase  53.49 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1395  phosphoserine aminotransferase  52.63 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.13819  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0844  phosphoserine aminotransferase  53.39 
 
 		 378 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.259314  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  52.68 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12357  predicted protein  54.49 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169231  normal  0.290006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2792  phosphoserine aminotransferase  50.87 
 
 		 368 aa  368  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159543 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2465  phosphoserine aminotransferase  52.34 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.394582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0773  phosphoserine aminotransferase  53.39 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431862  decreased coverage  0.00259178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2240  phosphoserine aminotransferase  54.09 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  51.64 
 
 		 359 aa  363  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>