236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1413 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 381 aa  794    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  74.4 
 
 		 373 aa  587  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  75.41 
 
 		 369 aa  587  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  61.2 
 
 		 361 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  60.05 
 
 		 360 aa  456  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  59.84 
 
 		 361 aa  454  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  59.29 
 
 		 361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  60.98 
 
 		 361 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  58.51 
 
 		 395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  59.29 
 
 		 361 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  59.02 
 
 		 363 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  58.74 
 
 		 361 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  58.42 
 
 		 360 aa  444  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  58.79 
 
 		 359 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2332  phosphoserine aminotransferase  57.88 
 
 		 361 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  57.38 
 
 		 359 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  58.74 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1115  phosphoserine aminotransferase  57.99 
 
 		 362 aa  429  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.27291 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  57.77 
 
 		 359 aa  429  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  57.38 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  56.83 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  57.07 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  56.25 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  56.52 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  55.16 
 
 		 361 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2041  phosphoserine aminotransferase  56.68 
 
 		 360 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  55.62 
 
 		 354 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  55.41 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003748  phosphoserine aminotransferase  55.77 
 
 		 364 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000403909  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1359  phosphoserine aminotransferase  58.31 
 
 		 335 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416954  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1041  phosphoserine aminotransferase  56.1 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147052  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1375  phosphoserine aminotransferase  58.02 
 
 		 335 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1075  phosphoserine aminotransferase  56.1 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25346 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1010  phosphoserine aminotransferase  56.1 
 
 		 362 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1090  phosphoserine aminotransferase  56.1 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.988584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0982  phosphoserine aminotransferase  56.1 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0279153  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2214  phosphoserine aminotransferase  55.56 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.183325  normal  0.123491 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00911  phosphoserine aminotransferase  55.56 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.500761  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2736  phosphoserine aminotransferase  55.83 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1068  phosphoserine aminotransferase  55.56 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0934537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1004  phosphoserine aminotransferase  55.56 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000735422  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00918  hypothetical protein  55.56 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2421  phosphoserine aminotransferase  55.56 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000598679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2689  phosphoserine aminotransferase  55.56 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00904863  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02623  phosphoserine aminotransferase  55.22 
 
 		 367 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1013  phosphoserine aminotransferase  55.56 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000154945  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1427  phosphoserine aminotransferase  55.01 
 
 		 362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  54.52 
 
 		 362 aa  401  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  52.97 
 
 		 362 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1947  phosphoserine aminotransferase  54.08 
 
 		 363 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  53.95 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  56.37 
 
 		 363 aa  403  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  54.52 
 
 		 362 aa  401  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1952  phosphoserine aminotransferase  52.45 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132565  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  54.08 
 
 		 377 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0728  phosphoserine aminotransferase  54.2 
 
 		 379 aa  398  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000226259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2671  phosphoserine aminotransferase  51.9 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.146724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2583  phosphoserine aminotransferase  51.9 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00074187  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2240  phosphoserine aminotransferase  52.99 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0005461  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  52.72 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1706  phosphoserine aminotransferase  54.35 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000174531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  51.5 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  52.42 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2078  phosphoserine aminotransferase  53.31 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  52.59 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2987  phosphoserine aminotransferase  50.69 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575995  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  52.03 
 
 		 387 aa  388  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2342  phosphoserine aminotransferase  52.45 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0172943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1732  phosphoserine aminotransferase  52.17 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1570  phosphoserine aminotransferase  48.53 
 
 		 370 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2000  phosphoserine aminotransferase  51.63 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.572206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2129  phosphoserine aminotransferase  52.6 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  50.41 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1950  phosphoserine aminotransferase  52.89 
 
 		 364 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.471166  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  49.59 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  49.59 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2540  phosphoserine aminotransferase  51.36 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0922  phosphoserine aminotransferase  50.41 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  49.86 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12357  predicted protein  51.76 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169231  normal  0.290006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0903  phosphoserine aminotransferase  51.37 
 
 		 378 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  49.86 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0611  phosphoserine aminotransferase  51.51 
 
 		 358 aa  376  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0918  phosphoserine aminotransferase  50.41 
 
 		 360 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2262  phosphoserine aminotransferase  50 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.022425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3281  phosphoserine aminotransferase  46.68 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0372795  normal  0.449595 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  49.59 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  48.63 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  52.47 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3079  phosphoserine aminotransferase  49.31 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2576  phosphoserine aminotransferase  49.87 
 
 		 383 aa  371  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0448308  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0844  phosphoserine aminotransferase  50 
 
 		 378 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.259314  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0563  phosphoserine aminotransferase  49.59 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1920  phosphoserine aminotransferase  51.51 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00965708  hitchhiker  0.00000000132125 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1001  phosphoserine aminotransferase  49.59 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2063  phosphoserine aminotransferase  50.68 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.234142  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0773  phosphoserine aminotransferase  50.27 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431862  decreased coverage  0.00259178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>