235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1950 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1950  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 364 aa  754    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.471166  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2307  phosphoserine aminotransferase  81.87 
 
 		 364 aa  629  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0347378  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1920  phosphoserine aminotransferase  78.45 
 
 		 363 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00965708  hitchhiker  0.00000000132125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2058  phosphoserine aminotransferase  78.45 
 
 		 363 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00301752  unclonable  0.0000270653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1973  phosphoserine aminotransferase  78.18 
 
 		 363 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000290161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2063  phosphoserine aminotransferase  77.07 
 
 		 363 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.234142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2410  phosphoserine aminotransferase  77.35 
 
 		 367 aa  595  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2403  phosphoserine aminotransferase  77.07 
 
 		 363 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.107805  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2059  phosphoserine aminotransferase  77.07 
 
 		 363 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0529016  unclonable  0.00000000000274518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2069  phosphoserine aminotransferase  76.52 
 
 		 363 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000307219  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2286  phosphoserine aminotransferase  75.69 
 
 		 363 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000800198  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2302  phosphoserine aminotransferase  76.24 
 
 		 364 aa  586  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.589874  hitchhiker  0.000000030251 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1732  phosphoserine aminotransferase  74.86 
 
 		 364 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.443235  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2069  phosphoserine aminotransferase  74.31 
 
 		 363 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311647  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1947  phosphoserine aminotransferase  74.03 
 
 		 363 aa  570  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2129  phosphoserine aminotransferase  72.65 
 
 		 363 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2332  phosphoserine aminotransferase  60.99 
 
 		 361 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  60 
 
 		 361 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1115  phosphoserine aminotransferase  58.61 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.27291 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00911  phosphoserine aminotransferase  57.53 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.500761  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2736  phosphoserine aminotransferase  57.53 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2421  phosphoserine aminotransferase  57.53 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000598679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1732  phosphoserine aminotransferase  57.58 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00918  hypothetical protein  57.53 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2689  phosphoserine aminotransferase  57.53 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00904863  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1013  phosphoserine aminotransferase  57.53 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000154945  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2214  phosphoserine aminotransferase  57.53 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.183325  normal  0.123491 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1068  phosphoserine aminotransferase  57.53 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0934537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1004  phosphoserine aminotransferase  57.26 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000735422  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1090  phosphoserine aminotransferase  57.53 
 
 		 362 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.988584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1041  phosphoserine aminotransferase  57.53 
 
 		 362 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147052  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1075  phosphoserine aminotransferase  57.53 
 
 		 362 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25346 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02623  phosphoserine aminotransferase  57.1 
 
 		 367 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2000  phosphoserine aminotransferase  56.75 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.572206  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1010  phosphoserine aminotransferase  57.53 
 
 		 362 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0982  phosphoserine aminotransferase  57.53 
 
 		 362 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0279153  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1427  phosphoserine aminotransferase  57.14 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003748  phosphoserine aminotransferase  57.38 
 
 		 364 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000403909  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2041  phosphoserine aminotransferase  56.47 
 
 		 360 aa  408  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2342  phosphoserine aminotransferase  56.75 
 
 		 361 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0172943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2671  phosphoserine aminotransferase  55.1 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.146724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2583  phosphoserine aminotransferase  55.1 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00074187  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1952  phosphoserine aminotransferase  54.82 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132565  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1706  phosphoserine aminotransferase  55.37 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000174531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2240  phosphoserine aminotransferase  55.62 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0005461  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0611  phosphoserine aminotransferase  53.52 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2078  phosphoserine aminotransferase  52.91 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0728  phosphoserine aminotransferase  55.83 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000226259  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  51.66 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  52.6 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  52.89 
 
 		 381 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  51.1 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  51.62 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  51.93 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  51.37 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  50.67 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  51.62 
 
 		 365 aa  378  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  53.46 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  51.66 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  50.82 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  51.63 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  51.93 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  52.65 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0252  phosphoserine aminotransferase  52.75 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  50.55 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  51.1 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  50.28 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  50 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  52.73 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  51.9 
 
 		 361 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  52.37 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  50.55 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  49.59 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  49.59 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  49.72 
 
 		 354 aa  361  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  49.59 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  49.05 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  51.64 
 
 		 361 aa  355  5.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  48.63 
 
 		 360 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1634  phosphoserine aminotransferase  49.72 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0740  phosphoserine aminotransferase  47.65 
 
 		 360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0976  phosphoserine aminotransferase  46.41 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  46.83 
 
 		 360 aa  349  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  47.12 
 
 		 360 aa  349  5e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  49.44 
 
 		 362 aa  348  6e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  49.44 
 
 		 362 aa  348  6e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0433  phosphoserine aminotransferase  48.9 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2998  phosphoserine aminotransferase  48.9 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2576  phosphoserine aminotransferase  48.9 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0951  phosphoserine aminotransferase  48.9 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2886  phosphoserine aminotransferase  48.9 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2949  phosphoserine aminotransferase  48.9 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0197  phosphoserine aminotransferase  48.9 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1538  phosphoserine aminotransferase  49.32 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0905864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4155  phosphoserine aminotransferase  48.32 
 
 		 360 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2540  phosphoserine aminotransferase  49.05 
 
 		 361 aa  345  6e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2262  phosphoserine aminotransferase  48.75 
 
 		 360 aa  345  8e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.022425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0639  phosphoserine aminotransferase  48.77 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0922  phosphoserine aminotransferase  48.19 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0918  phosphoserine aminotransferase  48.19 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>