252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0611 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0611  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 358 aa  746    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02623  phosphoserine aminotransferase  57.87 
 
 		 367 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003748  phosphoserine aminotransferase  57.06 
 
 		 364 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000403909  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2421  phosphoserine aminotransferase  57.3 
 
 		 362 aa  421  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000598679  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00911  phosphoserine aminotransferase  57.02 
 
 		 362 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.500761  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2736  phosphoserine aminotransferase  57.02 
 
 		 362 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2214  phosphoserine aminotransferase  57.02 
 
 		 362 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.183325  normal  0.123491 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0982  phosphoserine aminotransferase  56.46 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0279153  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1090  phosphoserine aminotransferase  56.46 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.988584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1004  phosphoserine aminotransferase  57.02 
 
 		 362 aa  421  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000735422  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1010  phosphoserine aminotransferase  56.46 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2689  phosphoserine aminotransferase  57.02 
 
 		 362 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00904863  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1041  phosphoserine aminotransferase  56.46 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147052  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1075  phosphoserine aminotransferase  56.46 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25346 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00918  hypothetical protein  57.02 
 
 		 362 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1068  phosphoserine aminotransferase  57.02 
 
 		 362 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0934537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1013  phosphoserine aminotransferase  57.02 
 
 		 362 aa  421  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000154945  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2332  phosphoserine aminotransferase  53.91 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2041  phosphoserine aminotransferase  55.74 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1706  phosphoserine aminotransferase  55.49 
 
 		 361 aa  411  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000174531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2342  phosphoserine aminotransferase  56.34 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0172943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1427  phosphoserine aminotransferase  56.18 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1952  phosphoserine aminotransferase  56.34 
 
 		 361 aa  408  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132565  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2000  phosphoserine aminotransferase  55.03 
 
 		 361 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.572206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  54.47 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2240  phosphoserine aminotransferase  56.06 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0005461  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1115  phosphoserine aminotransferase  54.9 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.27291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1732  phosphoserine aminotransferase  54.8 
 
 		 361 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2671  phosphoserine aminotransferase  56.34 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.146724  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  54.8 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0728  phosphoserine aminotransferase  55.9 
 
 		 379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000226259  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2583  phosphoserine aminotransferase  56.34 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00074187  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2302  phosphoserine aminotransferase  53.44 
 
 		 364 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.589874  hitchhiker  0.000000030251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  53.89 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1950  phosphoserine aminotransferase  53.52 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.471166  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1732  phosphoserine aminotransferase  53.19 
 
 		 364 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.443235  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  54.65 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  55.21 
 
 		 361 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2069  phosphoserine aminotransferase  52.78 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311647  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  52.6 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  54.97 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  52.35 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  52.26 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0252  phosphoserine aminotransferase  52.23 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1920  phosphoserine aminotransferase  50.42 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00965708  hitchhiker  0.00000000132125 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2307  phosphoserine aminotransferase  51.52 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0347378  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2403  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.107805  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2059  phosphoserine aminotransferase  49.86 
 
 		 363 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0529016  unclonable  0.00000000000274518 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1947  phosphoserine aminotransferase  49.72 
 
 		 363 aa  381  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2058  phosphoserine aminotransferase  49.86 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00301752  unclonable  0.0000270653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2129  phosphoserine aminotransferase  50.27 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1973  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000290161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2063  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.234142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2410  phosphoserine aminotransferase  50 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2286  phosphoserine aminotransferase  49.86 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000800198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2069  phosphoserine aminotransferase  49.86 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000307219  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  51.27 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  51.51 
 
 		 381 aa  376  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 362 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  50.7 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  49.44 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1314  phosphoserine aminotransferase  52.94 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.177266  hitchhiker  1.24275e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  49.17 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0494  phosphoserine aminotransferase  53.78 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000536248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  49.44 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  50 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  50.55 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2987  phosphoserine aminotransferase  48.61 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  49.17 
 
 		 360 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  49.86 
 
 		 373 aa  363  4e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  49.17 
 
 		 360 aa  362  6e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2078  phosphoserine aminotransferase  48.03 
 
 		 361 aa  362  7.0000000000000005e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 360 aa  361  8e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  50 
 
 		 361 aa  362  8e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  49.18 
 
 		 361 aa  361  8e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  48.61 
 
 		 360 aa  361  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0903  phosphoserine aminotransferase  48.63 
 
 		 378 aa  360  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  49.18 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 362 aa  359  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  49.45 
 
 		 369 aa  360  3e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0715  phosphoserine aminotransferase  49.04 
 
 		 387 aa  360  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  48.48 
 
 		 362 aa  359  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 362 aa  359  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  48.9 
 
 		 395 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  48.9 
 
 		 361 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  48.89 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  49.31 
 
 		 361 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  49.02 
 
 		 359 aa  358  8e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2576  phosphoserine aminotransferase  49.58 
 
 		 383 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0448308  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  49.59 
 
 		 365 aa  357  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  49.04 
 
 		 361 aa  355  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3079  phosphoserine aminotransferase  48.61 
 
 		 360 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3321  phosphoserine aminotransferase  48.61 
 
 		 360 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  49.16 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  48.88 
 
 		 387 aa  354  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0740  phosphoserine aminotransferase  49.45 
 
 		 360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0773  phosphoserine aminotransferase  48.08 
 
 		 378 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431862  decreased coverage  0.00259178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>