141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0009 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  96 
 
 
385 aa  731    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0813  phosphoserine aminotransferase  86.02 
 
 
384 aa  647    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  95.73 
 
 
385 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0009  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 
385 aa  771    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3317  phosphoserine aminotransferase  80.11 
 
 
384 aa  595  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0260  phosphoserine aminotransferase  76.86 
 
 
389 aa  590  1e-167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3020  phosphoserine aminotransferase  75.33 
 
 
381 aa  578  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1228  phosphoserine aminotransferase  73.4 
 
 
391 aa  569  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.858979  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1687  phosphoserine aminotransferase  72.63 
 
 
391 aa  567  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3596  phosphoserine aminotransferase  72.45 
 
 
392 aa  565  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1631  phosphoserine aminotransferase  72.63 
 
 
391 aa  567  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2619  phosphoserine aminotransferase  71.43 
 
 
392 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3487  phosphoserine aminotransferase  71.61 
 
 
392 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.146301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3193  phosphoserine aminotransferase  73.75 
 
 
392 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6799  phosphoserine aminotransferase  71.43 
 
 
390 aa  544  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3162  phosphoserine aminotransferase  68.97 
 
 
390 aa  540  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2137  phosphoserine aminotransferase  68.56 
 
 
390 aa  538  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6395  phosphoserine aminotransferase  72.21 
 
 
390 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1270  phosphoserine aminotransferase  70.65 
 
 
390 aa  536  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4686  phosphoserine aminotransferase  68.83 
 
 
385 aa  531  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0966475  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1203  phosphoserine aminotransferase  71.43 
 
 
391 aa  532  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509685  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4790  phosphoserine aminotransferase  70.13 
 
 
390 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3906  phosphoserine aminotransferase  69.87 
 
 
389 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1314  phosphoserine aminotransferase  69.61 
 
 
390 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  69.09 
 
 
390 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1825  phosphoserine aminotransferase  69.87 
 
 
390 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2969  phosphoserine aminotransferase  68.83 
 
 
390 aa  523  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3625  phosphoserine aminotransferase  68.57 
 
 
389 aa  524  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0111727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4107  phosphoserine aminotransferase  70.65 
 
 
390 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  69.09 
 
 
390 aa  520  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5460  phosphoserine aminotransferase  69.23 
 
 
385 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1332  phosphoserine aminotransferase  67.03 
 
 
371 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0670  phosphoserine aminotransferase  68.6 
 
 
391 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.786402  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0659  phosphoserine aminotransferase  68.6 
 
 
391 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.381901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0638  phosphoserine aminotransferase  68.87 
 
 
391 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612941  normal  0.204061 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0271  phosphoserine aminotransferase  63.8 
 
 
384 aa  502  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6961  phosphoserine aminotransferase  65.16 
 
 
399 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4468  phosphoserine aminotransferase  65.82 
 
 
395 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0805419  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0617  phosphoserine aminotransferase  63.1 
 
 
376 aa  489  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  63.25 
 
 
391 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  62.7 
 
 
379 aa  485  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1294  phosphoserine aminotransferase  62.37 
 
 
370 aa  481  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303177  normal  0.291609 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1104  phosphoserine aminotransferase  64.57 
 
 
384 aa  478  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1171  phosphoserine aminotransferase  61.01 
 
 
392 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861672  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  65.43 
 
 
396 aa  478  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0295  phosphoserine aminotransferase  60.54 
 
 
372 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000953711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  59.95 
 
 
374 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0477  phosphoserine aminotransferase  62.89 
 
 
393 aa  458  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108745 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42458  phosphoserine transaminase  60.21 
 
 
409 aa  451  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.809086  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  50 
 
 
410 aa  391  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  29.23 
 
 
383 aa  114  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  26.87 
 
 
370 aa  96.3  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  27.68 
 
 
387 aa  94  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  28.38 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  27.93 
 
 
382 aa  92  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  28.27 
 
 
374 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  27.25 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  28.01 
 
 
371 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  28.04 
 
 
395 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  26.19 
 
 
377 aa  89.7  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  26.56 
 
 
370 aa  89.4  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  29.19 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  28.42 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  25.91 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  27.3 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  26.74 
 
 
375 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  26.56 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  26.42 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  25.58 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  27.6 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  27.6 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  27.6 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  27.06 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  25.81 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  26.28 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  27.12 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  25.87 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  26.79 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  26.12 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  25.2 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  25.13 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  27.67 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  24.74 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  25.06 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  25.32 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  27.64 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  25.07 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  26.72 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  26.58 
 
 
393 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  24.33 
 
 
352 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  25.92 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4249  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  26.62 
 
 
993 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496909  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2576  phosphoserine aminotransferase  25.07 
 
 
383 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0448308  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0619  phosphoserine aminotransferase  23.81 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1278  phosphoserine aminotransferase  25.24 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0639  phosphoserine aminotransferase  24.23 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2462  phosphoserine aminotransferase  26.56 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51224  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  25.95 
 
 
365 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0715  phosphoserine aminotransferase  23.85 
 
 
387 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  25.44 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>