278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1278 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1278  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 360 aa  744    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1857  phosphoserine aminotransferase  55.56 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.729123  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08691  phosphoserine aminotransferase  53.76 
 
 		 355 aa  389  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2462  phosphoserine aminotransferase  53.59 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51224  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1962  phosphoserine aminotransferase  53.22 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1139  phosphoserine aminotransferase  51.52 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444246  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  48.62 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  48.49 
 
 		 360 aa  346  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  47.79 
 
 		 387 aa  346  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  48.34 
 
 		 360 aa  345  7e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  48.34 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  48.34 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  48.07 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2987  phosphoserine aminotransferase  47.79 
 
 		 360 aa  342  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  48.34 
 
 		 360 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  46.17 
 
 		 362 aa  342  7e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3221  phosphoserine aminotransferase  48.6 
 
 		 361 aa  339  4e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3079  phosphoserine aminotransferase  47.51 
 
 		 360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3321  phosphoserine aminotransferase  47.51 
 
 		 360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1454  phosphoserine aminotransferase  46.56 
 
 		 362 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  46.43 
 
 		 360 aa  333  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  45.71 
 
 		 359 aa  331  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2173  phosphoserine aminotransferase  46.83 
 
 		 372 aa  331  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  47.37 
 
 		 360 aa  329  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  46.03 
 
 		 359 aa  325  6e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0638  phosphoserine aminotransferase  45.18 
 
 		 360 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  45.33 
 
 		 362 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  45.03 
 
 		 360 aa  318  7.999999999999999e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  43.56 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1719  phosphoserine aminotransferase  46.45 
 
 		 360 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2083  phosphoserine aminotransferase  47.92 
 
 		 360 aa  316  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  44.93 
 
 		 361 aa  316  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1744  phosphoserine aminotransferase  44.44 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2078  phosphoserine aminotransferase  43.73 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0122  phosphoserine aminotransferase  44.72 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0735  phosphoserine aminotransferase  42.51 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000198961  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  43.18 
 
 		 373 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  42.31 
 
 		 381 aa  309  4e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  44.51 
 
 		 362 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  44.51 
 
 		 362 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  44.72 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  42.9 
 
 		 369 aa  306  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02623  phosphoserine aminotransferase  44.81 
 
 		 367 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1232  phosphoserine aminotransferase  44.2 
 
 		 358 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0903  phosphoserine aminotransferase  42.39 
 
 		 378 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  43.99 
 
 		 361 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  43.68 
 
 		 360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  44.44 
 
 		 360 aa  302  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  44.08 
 
 		 361 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0844  phosphoserine aminotransferase  41.58 
 
 		 378 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.259314  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  43.77 
 
 		 360 aa  299  5e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003748  phosphoserine aminotransferase  44.04 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000403909  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0773  phosphoserine aminotransferase  41.03 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431862  decreased coverage  0.00259178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  44.2 
 
 		 360 aa  296  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1676  phosphoserine aminotransferase  44.2 
 
 		 359 aa  295  6e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1292  phosphoserine aminotransferase  44.69 
 
 		 359 aa  295  9e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0728  phosphoserine aminotransferase  44.48 
 
 		 379 aa  295  9e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000226259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  42.9 
 
 		 361 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2041  phosphoserine aminotransferase  43.77 
 
 		 360 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1952  phosphoserine aminotransferase  44.35 
 
 		 361 aa  294  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132565  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1599  phosphoserine aminotransferase  42.82 
 
 		 359 aa  294  2e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.534688  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0715  phosphoserine aminotransferase  42.55 
 
 		 387 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2576  phosphoserine aminotransferase  42.74 
 
 		 383 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0448308  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  40.93 
 
 		 359 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0254  phosphoserine aminotransferase  43.82 
 
 		 359 aa  293  4e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.258322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  42.58 
 
 		 361 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  42.94 
 
 		 361 aa  292  7e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  42.31 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3363  phosphoserine aminotransferase  44.01 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0371  phosphoserine aminotransferase  42.15 
 
 		 358 aa  291  2e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2583  phosphoserine aminotransferase  43.8 
 
 		 361 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00074187  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2671  phosphoserine aminotransferase  43.8 
 
 		 361 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.146724  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  42.62 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1947  phosphoserine aminotransferase  40.88 
 
 		 363 aa  290  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  42.19 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  42.62 
 
 		 361 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2342  phosphoserine aminotransferase  43.89 
 
 		 361 aa  290  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0172943  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0611  phosphoserine aminotransferase  40.6 
 
 		 358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  41.76 
 
 		 360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0348  phosphoserine aminotransferase  41.87 
 
 		 358 aa  288  7e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2302  phosphoserine aminotransferase  41.67 
 
 		 364 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.589874  hitchhiker  0.000000030251 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0740  phosphoserine aminotransferase  42.19 
 
 		 360 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2214  phosphoserine aminotransferase  43.45 
 
 		 361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2792  phosphoserine aminotransferase  40.65 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159543 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  42.08 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  40.11 
 
 		 354 aa  286  5e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2332  phosphoserine aminotransferase  42.82 
 
 		 361 aa  286  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  41.48 
 
 		 361 aa  285  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1350  phosphoserine aminotransferase  41.87 
 
 		 358 aa  285  7e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  39.84 
 
 		 360 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  42.12 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2000  phosphoserine aminotransferase  43.45 
 
 		 361 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.572206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2240  phosphoserine aminotransferase  43.92 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0005461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2540  phosphoserine aminotransferase  41.1 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0976  phosphoserine aminotransferase  41.92 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0619  phosphoserine aminotransferase  43.84 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1973  phosphoserine aminotransferase  41.44 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000290161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1920  phosphoserine aminotransferase  41.44 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00965708  hitchhiker  0.00000000132125 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1732  phosphoserine aminotransferase  42.62 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  41.37 
 
 		 360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>