269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2462 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2462  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 
356 aa  734    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51224  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08691  phosphoserine aminotransferase  70.06 
 
 
355 aa  504  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1962  phosphoserine aminotransferase  62.89 
 
 
353 aa  463  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1857  phosphoserine aminotransferase  60.34 
 
 
354 aa  457  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.729123  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1139  phosphoserine aminotransferase  56.86 
 
 
356 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444246  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_002950  PG1278  phosphoserine aminotransferase  53.59 
 
 
360 aa  385  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1454  phosphoserine aminotransferase  49.02 
 
 
362 aa  345  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  48.45 
 
 
360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2173  phosphoserine aminotransferase  46.91 
 
 
372 aa  335  9e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2987  phosphoserine aminotransferase  46.2 
 
 
360 aa  330  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575995  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  45.66 
 
 
359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  46.48 
 
 
360 aa  326  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0638  phosphoserine aminotransferase  46.44 
 
 
360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  46.2 
 
 
360 aa  325  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  46.48 
 
 
360 aa  325  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  45.92 
 
 
360 aa  325  6e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  46.2 
 
 
360 aa  325  7e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  45.92 
 
 
360 aa  324  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3221  phosphoserine aminotransferase  47.31 
 
 
361 aa  324  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1719  phosphoserine aminotransferase  46.24 
 
 
360 aa  324  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  46.2 
 
 
360 aa  322  7e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2083  phosphoserine aminotransferase  48.17 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  47.03 
 
 
361 aa  321  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  44.38 
 
 
359 aa  318  9e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3079  phosphoserine aminotransferase  45.63 
 
 
360 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3321  phosphoserine aminotransferase  45.63 
 
 
360 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1744  phosphoserine aminotransferase  45.61 
 
 
360 aa  317  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  44.19 
 
 
360 aa  316  5e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  44.1 
 
 
387 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  44.1 
 
 
362 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0122  phosphoserine aminotransferase  44.1 
 
 
363 aa  311  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  43.89 
 
 
362 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02623  phosphoserine aminotransferase  44.35 
 
 
367 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  42.86 
 
 
360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003748  phosphoserine aminotransferase  44.03 
 
 
364 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000403909  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  42.3 
 
 
360 aa  305  7e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  42.54 
 
 
360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2041  phosphoserine aminotransferase  43.98 
 
 
360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  43.7 
 
 
361 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0735  phosphoserine aminotransferase  44.38 
 
 
364 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000198961  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1950  phosphoserine aminotransferase  43.85 
 
 
364 aa  300  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.471166  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  40.28 
 
 
359 aa  300  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1232  phosphoserine aminotransferase  44.41 
 
 
358 aa  300  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  43.42 
 
 
395 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  43.42 
 
 
363 aa  298  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0728  phosphoserine aminotransferase  43.94 
 
 
379 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000226259  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  42.58 
 
 
381 aa  296  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  42.13 
 
 
360 aa  296  5e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  42.86 
 
 
361 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  42.86 
 
 
361 aa  295  9e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  42.86 
 
 
361 aa  295  9e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  41.9 
 
 
369 aa  295  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  43.14 
 
 
362 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  43.14 
 
 
361 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  43.14 
 
 
362 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3363  phosphoserine aminotransferase  45.43 
 
 
361 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0371  phosphoserine aminotransferase  43.73 
 
 
358 aa  293  3e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2240  phosphoserine aminotransferase  44.23 
 
 
361 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0005461  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  41.9 
 
 
373 aa  293  5e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  42.09 
 
 
360 aa  292  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2332  phosphoserine aminotransferase  42.54 
 
 
361 aa  292  7e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  40.34 
 
 
360 aa  291  8e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  43.42 
 
 
361 aa  291  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1632  phosphoserine aminotransferase  43.73 
 
 
358 aa  291  9e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  43.02 
 
 
361 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0348  phosphoserine aminotransferase  43.45 
 
 
358 aa  290  2e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  42.09 
 
 
360 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2214  phosphoserine aminotransferase  45.71 
 
 
361 aa  290  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.277 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  43.14 
 
 
361 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1952  phosphoserine aminotransferase  43.54 
 
 
361 aa  288  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132565  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2671  phosphoserine aminotransferase  42.98 
 
 
361 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.146724  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1676  phosphoserine aminotransferase  43.92 
 
 
359 aa  287  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2583  phosphoserine aminotransferase  42.98 
 
 
361 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00074187  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0903  phosphoserine aminotransferase  41.16 
 
 
378 aa  286  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1706  phosphoserine aminotransferase  43.26 
 
 
361 aa  285  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000174531  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  40.95 
 
 
365 aa  285  7e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  42.74 
 
 
360 aa  285  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1732  phosphoserine aminotransferase  44.13 
 
 
361 aa  285  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2307  phosphoserine aminotransferase  43.58 
 
 
364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0347378  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  41.62 
 
 
361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  41.08 
 
 
359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  39.78 
 
 
354 aa  282  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0254  phosphoserine aminotransferase  43.18 
 
 
359 aa  282  7.000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.258322  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  41.34 
 
 
377 aa  281  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  41.34 
 
 
361 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1599  phosphoserine aminotransferase  43.58 
 
 
359 aa  280  2e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.534688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2342  phosphoserine aminotransferase  43.66 
 
 
361 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0172943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2302  phosphoserine aminotransferase  42.46 
 
 
364 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.589874  hitchhiker  0.000000030251 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0611  phosphoserine aminotransferase  41.6 
 
 
358 aa  280  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2000  phosphoserine aminotransferase  43.55 
 
 
361 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.572206  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1292  phosphoserine aminotransferase  43.66 
 
 
359 aa  279  5e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0773  phosphoserine aminotransferase  39.5 
 
 
378 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431862  decreased coverage  0.00259178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2443  phosphoserine aminotransferase  42.9 
 
 
360 aa  278  7e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0844  phosphoserine aminotransferase  39.5 
 
 
378 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.259314  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1359  phosphoserine aminotransferase  43.71 
 
 
335 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416954  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1973  phosphoserine aminotransferase  40.78 
 
 
363 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000290161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1793  phosphoserine aminotransferase  39.62 
 
 
368 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1920  phosphoserine aminotransferase  40.78 
 
 
363 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00965708  hitchhiker  0.00000000132125 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1010  phosphoserine aminotransferase  42.42 
 
 
362 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1075  phosphoserine aminotransferase  42.42 
 
 
362 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.25346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>