242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1744 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1744  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 360 aa  750    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0122  phosphoserine aminotransferase  58.33 
 
 		 363 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1719  phosphoserine aminotransferase  55.87 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  54.44 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1454  phosphoserine aminotransferase  53.74 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3221  phosphoserine aminotransferase  53.35 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978624  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  52.22 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0638  phosphoserine aminotransferase  52.68 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  52.09 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2214  phosphoserine aminotransferase  51.25 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  50 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  51.93 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2173  phosphoserine aminotransferase  51.8 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  50.7 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3363  phosphoserine aminotransferase  49.86 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  48.76 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2083  phosphoserine aminotransferase  52.23 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0735  phosphoserine aminotransferase  49.86 
 
 		 364 aa  362  4e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000198961  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2987  phosphoserine aminotransferase  47.91 
 
 		 360 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  48.33 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  48.19 
 
 		 360 aa  359  5e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  47.91 
 
 		 360 aa  358  6e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  48.45 
 
 		 360 aa  358  8e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  49.58 
 
 		 361 aa  358  8e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1232  phosphoserine aminotransferase  49.72 
 
 		 358 aa  358  8e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  48.88 
 
 		 360 aa  358  8e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  48.17 
 
 		 360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  48.17 
 
 		 360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  49.86 
 
 		 359 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  47.89 
 
 		 360 aa  355  5e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  48.48 
 
 		 365 aa  355  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  47.35 
 
 		 360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  49.31 
 
 		 363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0740  phosphoserine aminotransferase  47.37 
 
 		 360 aa  352  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  48.6 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  47.35 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  48.46 
 
 		 359 aa  349  5e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3079  phosphoserine aminotransferase  47.32 
 
 		 360 aa  348  6e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3321  phosphoserine aminotransferase  47.32 
 
 		 360 aa  348  6e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  47.5 
 
 		 360 aa  348  8e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  46.54 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2443  phosphoserine aminotransferase  47.21 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  47.34 
 
 		 360 aa  345  6e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  47.75 
 
 		 360 aa  345  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  47.92 
 
 		 363 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0976  phosphoserine aminotransferase  45.98 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0903  phosphoserine aminotransferase  45.58 
 
 		 378 aa  343  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  47.63 
 
 		 361 aa  342  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1676  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 		 359 aa  342  7e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0918  phosphoserine aminotransferase  47.09 
 
 		 360 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0433  phosphoserine aminotransferase  47.37 
 
 		 360 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2998  phosphoserine aminotransferase  47.37 
 
 		 360 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2576  phosphoserine aminotransferase  47.37 
 
 		 360 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0951  phosphoserine aminotransferase  47.37 
 
 		 360 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2886  phosphoserine aminotransferase  47.37 
 
 		 360 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2949  phosphoserine aminotransferase  47.37 
 
 		 360 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0197  phosphoserine aminotransferase  47.37 
 
 		 360 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4155  phosphoserine aminotransferase  46.26 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0922  phosphoserine aminotransferase  46.81 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  47.93 
 
 		 362 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  46.11 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  47.93 
 
 		 362 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2262  phosphoserine aminotransferase  46.81 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.022425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1634  phosphoserine aminotransferase  46.81 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1719  phosphoserine aminotransferase  45.84 
 
 		 375 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.442694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  46.28 
 
 		 361 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  46.52 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  46.93 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  46.8 
 
 		 361 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  45.96 
 
 		 361 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1001  phosphoserine aminotransferase  45.71 
 
 		 360 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0844  phosphoserine aminotransferase  44.2 
 
 		 378 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.259314  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  46.24 
 
 		 395 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0563  phosphoserine aminotransferase  45.71 
 
 		 360 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1042  phosphoserine aminotransferase  45.71 
 
 		 360 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943212  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0773  phosphoserine aminotransferase  44.48 
 
 		 378 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431862  decreased coverage  0.00259178 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0254  phosphoserine aminotransferase  48.6 
 
 		 359 aa  335  1e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.258322  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1599  phosphoserine aminotransferase  49.31 
 
 		 359 aa  333  3e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.534688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1139  phosphoserine aminotransferase  44.54 
 
 		 356 aa  332  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444246  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1292  phosphoserine aminotransferase  49.31 
 
 		 359 aa  332  5e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  45.4 
 
 		 359 aa  331  9e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  44.85 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  46.28 
 
 		 377 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0611  phosphoserine aminotransferase  46.13 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  45.96 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0348  phosphoserine aminotransferase  47.12 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1632  phosphoserine aminotransferase  47.09 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  46.15 
 
 		 369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0715  phosphoserine aminotransferase  44.02 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  44.01 
 
 		 361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0371  phosphoserine aminotransferase  47.12 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2576  phosphoserine aminotransferase  44.02 
 
 		 383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0448308  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2041  phosphoserine aminotransferase  45.28 
 
 		 360 aa  326  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1350  phosphoserine aminotransferase  45.71 
 
 		 358 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0619  phosphoserine aminotransferase  47.66 
 
 		 365 aa  326  5e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2465  phosphoserine aminotransferase  45.08 
 
 		 371 aa  325  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.394582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1857  phosphoserine aminotransferase  45.04 
 
 		 354 aa  325  6e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.729123  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1962  phosphoserine aminotransferase  45.71 
 
 		 353 aa  323  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12357  predicted protein  45.86 
 
 		 394 aa  323  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169231  normal  0.290006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>