249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1962 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1962  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 353 aa  728    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2462  phosphoserine aminotransferase  62.89 
 
 		 356 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51224  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08691  phosphoserine aminotransferase  57.51 
 
 		 355 aa  431  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1139  phosphoserine aminotransferase  56.7 
 
 		 356 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444246  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1857  phosphoserine aminotransferase  53.01 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.729123  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_002950  PG1278  phosphoserine aminotransferase  53.22 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2987  phosphoserine aminotransferase  50 
 
 		 360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1454  phosphoserine aminotransferase  50.7 
 
 		 362 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  48.87 
 
 		 360 aa  348  6e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  49.43 
 
 		 360 aa  348  7e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  48.86 
 
 		 360 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  48.86 
 
 		 360 aa  342  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  48.86 
 
 		 360 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  48.58 
 
 		 360 aa  342  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  48.58 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0638  phosphoserine aminotransferase  47.32 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  48.01 
 
 		 360 aa  338  9e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3079  phosphoserine aminotransferase  48.3 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3321  phosphoserine aminotransferase  48.3 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  48.46 
 
 		 361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  46.31 
 
 		 359 aa  335  9e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1232  phosphoserine aminotransferase  47.03 
 
 		 358 aa  333  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3221  phosphoserine aminotransferase  47.46 
 
 		 361 aa  331  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978624  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  47.61 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3363  phosphoserine aminotransferase  48.02 
 
 		 361 aa  328  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1719  phosphoserine aminotransferase  46.76 
 
 		 360 aa  328  6e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2083  phosphoserine aminotransferase  48.6 
 
 		 360 aa  327  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0122  phosphoserine aminotransferase  47.34 
 
 		 363 aa  326  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  46.35 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  47.22 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  47.88 
 
 		 362 aa  323  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1744  phosphoserine aminotransferase  45.71 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  45.04 
 
 		 387 aa  323  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2214  phosphoserine aminotransferase  46.61 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0735  phosphoserine aminotransferase  46.26 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000198961  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  46.35 
 
 		 359 aa  322  8e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  47.04 
 
 		 361 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0371  phosphoserine aminotransferase  46.2 
 
 		 358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  46.76 
 
 		 395 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  45.45 
 
 		 360 aa  318  7.999999999999999e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1632  phosphoserine aminotransferase  45.35 
 
 		 358 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  46.72 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0348  phosphoserine aminotransferase  45.92 
 
 		 358 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  45.04 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2173  phosphoserine aminotransferase  46.33 
 
 		 372 aa  315  8e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  47.04 
 
 		 361 aa  315  9e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  46.76 
 
 		 361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1292  phosphoserine aminotransferase  48.43 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  46.48 
 
 		 361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2443  phosphoserine aminotransferase  45.92 
 
 		 360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  45.35 
 
 		 361 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  43.26 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  46.48 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  46.2 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  46.76 
 
 		 361 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  46.76 
 
 		 360 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0903  phosphoserine aminotransferase  43.96 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  45.35 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  43.94 
 
 		 360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  43.66 
 
 		 360 aa  305  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003748  phosphoserine aminotransferase  46.33 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000403909  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0254  phosphoserine aminotransferase  45.07 
 
 		 359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.258322  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  43.58 
 
 		 381 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  44.73 
 
 		 359 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  43.85 
 
 		 360 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  43.42 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1676  phosphoserine aminotransferase  45.13 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  45.07 
 
 		 362 aa  299  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  45.07 
 
 		 362 aa  299  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1375  phosphoserine aminotransferase  46.99 
 
 		 335 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2041  phosphoserine aminotransferase  44.63 
 
 		 360 aa  298  9e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0844  phosphoserine aminotransferase  41.76 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.259314  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0773  phosphoserine aminotransferase  41.48 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431862  decreased coverage  0.00259178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1570  phosphoserine aminotransferase  41.92 
 
 		 370 aa  297  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  45.22 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1359  phosphoserine aminotransferase  46.69 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416954  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02623  phosphoserine aminotransferase  45.33 
 
 		 367 aa  296  5e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1350  phosphoserine aminotransferase  42.13 
 
 		 358 aa  296  5e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  42.54 
 
 		 373 aa  295  9e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2240  phosphoserine aminotransferase  45.33 
 
 		 361 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0005461  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1634  phosphoserine aminotransferase  43.7 
 
 		 360 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  41.97 
 
 		 369 aa  293  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2332  phosphoserine aminotransferase  43.91 
 
 		 361 aa  292  6e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0433  phosphoserine aminotransferase  43.7 
 
 		 360 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2998  phosphoserine aminotransferase  43.7 
 
 		 360 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2576  phosphoserine aminotransferase  43.7 
 
 		 360 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0951  phosphoserine aminotransferase  43.7 
 
 		 360 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2886  phosphoserine aminotransferase  43.7 
 
 		 360 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2949  phosphoserine aminotransferase  43.7 
 
 		 360 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0197  phosphoserine aminotransferase  43.7 
 
 		 360 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1793  phosphoserine aminotransferase  41.05 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00029635 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  42.78 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0740  phosphoserine aminotransferase  41.74 
 
 		 360 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2792  phosphoserine aminotransferase  41.67 
 
 		 368 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159543 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  40.96 
 
 		 354 aa  288  7e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0976  phosphoserine aminotransferase  41.18 
 
 		 360 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2078  phosphoserine aminotransferase  42.09 
 
 		 361 aa  288  7e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1395  phosphoserine aminotransferase  41.73 
 
 		 371 aa  288  9e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.13819  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1952  phosphoserine aminotransferase  44.35 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132565  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  41.18 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>