255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2173 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2173  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 372 aa  764    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2214  phosphoserine aminotransferase  60.06 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3363  phosphoserine aminotransferase  58.94 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0638  phosphoserine aminotransferase  55.03 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3221  phosphoserine aminotransferase  54.14 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1454  phosphoserine aminotransferase  53.35 
 
 		 362 aa  381  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2443  phosphoserine aminotransferase  53.48 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1719  phosphoserine aminotransferase  51.68 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1744  phosphoserine aminotransferase  51.8 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  51.12 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  52.1 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  51.83 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1232  phosphoserine aminotransferase  53.22 
 
 		 358 aa  362  8e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2083  phosphoserine aminotransferase  53.33 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  51.12 
 
 		 360 aa  359  5e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  51.39 
 
 		 361 aa  358  7e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 		 359 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1139  phosphoserine aminotransferase  48.86 
 
 		 356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444246  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  50.97 
 
 		 363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  50.99 
 
 		 362 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  49.44 
 
 		 361 aa  353  4e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  49.58 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  49.58 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  49.72 
 
 		 361 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  48.59 
 
 		 360 aa  349  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  46.86 
 
 		 381 aa  348  6e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  48.31 
 
 		 360 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  48.31 
 
 		 360 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0735  phosphoserine aminotransferase  49.04 
 
 		 364 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000198961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  48.59 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  50.97 
 
 		 377 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2987  phosphoserine aminotransferase  47.74 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  48.31 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  48.31 
 
 		 360 aa  347  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  50 
 
 		 360 aa  346  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  50 
 
 		 360 aa  346  4e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  49.72 
 
 		 361 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  48.31 
 
 		 360 aa  345  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1857  phosphoserine aminotransferase  46.89 
 
 		 354 aa  344  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.729123  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  49.17 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  50.28 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  48.02 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  49.17 
 
 		 395 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  48.6 
 
 		 362 aa  342  7e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  47.49 
 
 		 360 aa  341  9e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3079  phosphoserine aminotransferase  47.74 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3321  phosphoserine aminotransferase  47.74 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0122  phosphoserine aminotransferase  50.96 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  49.72 
 
 		 361 aa  338  9e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  47.21 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  47.77 
 
 		 362 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  47.77 
 
 		 362 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2462  phosphoserine aminotransferase  46.91 
 
 		 356 aa  335  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  48.89 
 
 		 361 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2041  phosphoserine aminotransferase  48.47 
 
 		 360 aa  335  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1676  phosphoserine aminotransferase  49.03 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1719  phosphoserine aminotransferase  48.39 
 
 		 375 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.442694 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  47.77 
 
 		 360 aa  333  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  48.6 
 
 		 360 aa  333  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1599  phosphoserine aminotransferase  49.03 
 
 		 359 aa  333  4e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.534688  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  47.11 
 
 		 365 aa  332  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  47.77 
 
 		 361 aa  332  6e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  43.42 
 
 		 354 aa  332  7.000000000000001e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0348  phosphoserine aminotransferase  47.22 
 
 		 358 aa  332  7.000000000000001e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1278  phosphoserine aminotransferase  46.83 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0371  phosphoserine aminotransferase  47.5 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  49.44 
 
 		 359 aa  331  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2332  phosphoserine aminotransferase  45.38 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1632  phosphoserine aminotransferase  46.67 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0254  phosphoserine aminotransferase  47.5 
 
 		 359 aa  329  6e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.258322  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2540  phosphoserine aminotransferase  46.24 
 
 		 361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0639  phosphoserine aminotransferase  45.56 
 
 		 360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0740  phosphoserine aminotransferase  46.22 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1538  phosphoserine aminotransferase  45.56 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0905864  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1947  phosphoserine aminotransferase  45.03 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  46.09 
 
 		 360 aa  327  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  46.17 
 
 		 369 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  44.85 
 
 		 361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003748  phosphoserine aminotransferase  47.09 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000403909  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02623  phosphoserine aminotransferase  46.72 
 
 		 367 aa  326  5e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  45.98 
 
 		 363 aa  325  9e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1359  phosphoserine aminotransferase  50.3 
 
 		 335 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416954  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  45.86 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1489  phosphoserine aminotransferase  48.08 
 
 		 364 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0105187  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1292  phosphoserine aminotransferase  47.92 
 
 		 359 aa  320  3e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08691  phosphoserine aminotransferase  47.19 
 
 		 355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2129  phosphoserine aminotransferase  44.01 
 
 		 363 aa  317  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1375  phosphoserine aminotransferase  49.7 
 
 		 335 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0922  phosphoserine aminotransferase  46.5 
 
 		 360 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1373  phosphoserine aminotransferase  45.43 
 
 		 362 aa  315  6e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0773  phosphoserine aminotransferase  44.14 
 
 		 378 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431862  decreased coverage  0.00259178 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0918  phosphoserine aminotransferase  46.22 
 
 		 360 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1962  phosphoserine aminotransferase  46.33 
 
 		 353 aa  315  9e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0903  phosphoserine aminotransferase  44.41 
 
 		 378 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4155  phosphoserine aminotransferase  45.66 
 
 		 360 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1001  phosphoserine aminotransferase  45.94 
 
 		 360 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1115  phosphoserine aminotransferase  45.15 
 
 		 362 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.27291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2262  phosphoserine aminotransferase  46.5 
 
 		 360 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.022425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  44.54 
 
 		 360 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2671  phosphoserine aminotransferase  46.8 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.146724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>