249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0735 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0735  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 
364 aa  758    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000198961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  56.95 
 
 
387 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  54.97 
 
 
360 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2987  phosphoserine aminotransferase  53.87 
 
 
360 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  53.31 
 
 
360 aa  411  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  53.59 
 
 
360 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  53.31 
 
 
360 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  53.31 
 
 
360 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  53.04 
 
 
360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  52.76 
 
 
360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  52.76 
 
 
360 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  54.62 
 
 
360 aa  403  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  54.7 
 
 
359 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  53.42 
 
 
362 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3079  phosphoserine aminotransferase  52.49 
 
 
360 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3321  phosphoserine aminotransferase  52.49 
 
 
360 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  52.21 
 
 
360 aa  388  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3221  phosphoserine aminotransferase  50.42 
 
 
361 aa  375  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1454  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 
362 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  50.55 
 
 
360 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  51.91 
 
 
361 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0638  phosphoserine aminotransferase  50.83 
 
 
360 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  51.1 
 
 
360 aa  371  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  50.55 
 
 
360 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  50.27 
 
 
362 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1744  phosphoserine aminotransferase  49.86 
 
 
360 aa  362  4e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  51.53 
 
 
359 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  49.03 
 
 
360 aa  361  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2214  phosphoserine aminotransferase  50.68 
 
 
361 aa  358  7e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.277 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  50.68 
 
 
363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  49.31 
 
 
361 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  48.79 
 
 
365 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  48.08 
 
 
360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  49.18 
 
 
359 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0903  phosphoserine aminotransferase  47.17 
 
 
378 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  48.21 
 
 
359 aa  355  5.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1489  phosphoserine aminotransferase  49.32 
 
 
364 aa  354  1e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0105187  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3363  phosphoserine aminotransferase  49.04 
 
 
361 aa  353  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  49.18 
 
 
377 aa  353  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  48.75 
 
 
361 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  50 
 
 
361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  49.17 
 
 
361 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  46.87 
 
 
361 aa  352  4e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2332  phosphoserine aminotransferase  47.12 
 
 
361 aa  352  5e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2262  phosphoserine aminotransferase  48.22 
 
 
360 aa  351  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.022425  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0740  phosphoserine aminotransferase  47.81 
 
 
360 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  47.53 
 
 
360 aa  349  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4155  phosphoserine aminotransferase  48.09 
 
 
360 aa  349  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0922  phosphoserine aminotransferase  48.36 
 
 
360 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0844  phosphoserine aminotransferase  46.32 
 
 
378 aa  348  6e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.259314  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2173  phosphoserine aminotransferase  49.04 
 
 
372 aa  348  9e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  47.12 
 
 
361 aa  347  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  47.53 
 
 
363 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0773  phosphoserine aminotransferase  46.59 
 
 
378 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431862  decreased coverage  0.00259178 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0918  phosphoserine aminotransferase  47.81 
 
 
360 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2083  phosphoserine aminotransferase  48.61 
 
 
360 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  48.2 
 
 
361 aa  346  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  49.2 
 
 
381 aa  345  7e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2576  phosphoserine aminotransferase  45.43 
 
 
383 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0448308  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  46.72 
 
 
360 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1634  phosphoserine aminotransferase  46.32 
 
 
360 aa  344  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  46.45 
 
 
360 aa  343  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0122  phosphoserine aminotransferase  50.28 
 
 
363 aa  343  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1001  phosphoserine aminotransferase  47.27 
 
 
360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  46.81 
 
 
361 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0715  phosphoserine aminotransferase  46.54 
 
 
387 aa  342  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  46.81 
 
 
395 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0563  phosphoserine aminotransferase  46.99 
 
 
360 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1042  phosphoserine aminotransferase  46.99 
 
 
360 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943212  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  48.2 
 
 
362 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  48.2 
 
 
362 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0976  phosphoserine aminotransferase  46.17 
 
 
360 aa  339  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33803  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  47.57 
 
 
361 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0433  phosphoserine aminotransferase  45.5 
 
 
360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2998  phosphoserine aminotransferase  45.5 
 
 
360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2576  phosphoserine aminotransferase  45.5 
 
 
360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0951  phosphoserine aminotransferase  45.5 
 
 
360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2886  phosphoserine aminotransferase  45.5 
 
 
360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2949  phosphoserine aminotransferase  45.5 
 
 
360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0197  phosphoserine aminotransferase  45.5 
 
 
360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1115  phosphoserine aminotransferase  45.38 
 
 
362 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.27291 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  44.78 
 
 
354 aa  334  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0619  phosphoserine aminotransferase  47.41 
 
 
365 aa  334  2e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2443  phosphoserine aminotransferase  46.56 
 
 
360 aa  333  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  46.76 
 
 
369 aa  332  5e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  47.15 
 
 
373 aa  331  1e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1719  phosphoserine aminotransferase  44.48 
 
 
360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1139  phosphoserine aminotransferase  43.92 
 
 
356 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444246  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  43.84 
 
 
361 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1232  phosphoserine aminotransferase  45.78 
 
 
358 aa  325  5e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1570  phosphoserine aminotransferase  45.19 
 
 
370 aa  325  6e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12357  predicted protein  45.9 
 
 
394 aa  324  1e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169231  normal  0.290006 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2078  phosphoserine aminotransferase  43.84 
 
 
361 aa  324  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1962  phosphoserine aminotransferase  46.26 
 
 
353 aa  323  3e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1618  phosphoserine aminotransferase  44.99 
 
 
377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1314  phosphoserine aminotransferase  46.76 
 
 
365 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.177266  hitchhiker  1.24275e-22 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0494  phosphoserine aminotransferase  46.87 
 
 
365 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000536248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1793  phosphoserine aminotransferase  44.53 
 
 
368 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029635 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1292  phosphoserine aminotransferase  47.09 
 
 
359 aa  320  3.9999999999999996e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1359  phosphoserine aminotransferase  46.59 
 
 
335 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416954  normal  0.10133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>