238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1350 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1350  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 
358 aa  738    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0348  phosphoserine aminotransferase  75.14 
 
 
358 aa  578  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0371  phosphoserine aminotransferase  74.86 
 
 
358 aa  574  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1632  phosphoserine aminotransferase  75.42 
 
 
358 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1676  phosphoserine aminotransferase  62.75 
 
 
359 aa  487  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1599  phosphoserine aminotransferase  59.94 
 
 
359 aa  474  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.534688  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1292  phosphoserine aminotransferase  59.22 
 
 
359 aa  463  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0254  phosphoserine aminotransferase  57.7 
 
 
359 aa  429  1e-119  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.258322  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1719  phosphoserine aminotransferase  47.11 
 
 
360 aa  348  9e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1454  phosphoserine aminotransferase  46.26 
 
 
362 aa  345  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  45.98 
 
 
360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  47.37 
 
 
387 aa  334  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3221  phosphoserine aminotransferase  45.98 
 
 
361 aa  333  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0638  phosphoserine aminotransferase  45.68 
 
 
360 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3363  phosphoserine aminotransferase  44.17 
 
 
361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  45.15 
 
 
359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1744  phosphoserine aminotransferase  45.71 
 
 
360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2083  phosphoserine aminotransferase  46.54 
 
 
360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1232  phosphoserine aminotransferase  44.29 
 
 
358 aa  322  4e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2214  phosphoserine aminotransferase  44.29 
 
 
361 aa  322  7e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.277 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2443  phosphoserine aminotransferase  44.04 
 
 
360 aa  322  8e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  45.79 
 
 
362 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  44.04 
 
 
360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  44.48 
 
 
361 aa  312  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  42.54 
 
 
361 aa  311  7.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1857  phosphoserine aminotransferase  45.35 
 
 
354 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.729123  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1139  phosphoserine aminotransferase  44.72 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444246  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  42.22 
 
 
362 aa  306  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  42.22 
 
 
362 aa  306  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2173  phosphoserine aminotransferase  43.06 
 
 
372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  42.94 
 
 
359 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0122  phosphoserine aminotransferase  43.77 
 
 
363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  43.13 
 
 
369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  43.42 
 
 
360 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  43.65 
 
 
361 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  42.27 
 
 
361 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  41.55 
 
 
360 aa  299  6e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  42.93 
 
 
381 aa  298  7e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  42.86 
 
 
360 aa  296  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  42.03 
 
 
373 aa  296  3e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  42.86 
 
 
360 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  42.86 
 
 
360 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1962  phosphoserine aminotransferase  42.13 
 
 
353 aa  296  5e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  42.3 
 
 
360 aa  295  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  41 
 
 
361 aa  295  8e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  43.65 
 
 
360 aa  295  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2987  phosphoserine aminotransferase  42.3 
 
 
360 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575995  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  42.54 
 
 
359 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  41.64 
 
 
360 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0976  phosphoserine aminotransferase  41.64 
 
 
360 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33803  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0740  phosphoserine aminotransferase  41.48 
 
 
360 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  42.02 
 
 
360 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  41.27 
 
 
361 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  42.58 
 
 
360 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  41.6 
 
 
362 aa  292  7e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  41.78 
 
 
354 aa  292  8e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0735  phosphoserine aminotransferase  42.62 
 
 
364 aa  290  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000198961  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  41.94 
 
 
360 aa  289  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1719  phosphoserine aminotransferase  40.91 
 
 
375 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.442694 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3079  phosphoserine aminotransferase  42.3 
 
 
360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3321  phosphoserine aminotransferase  42.3 
 
 
360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  41 
 
 
361 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  42.86 
 
 
360 aa  288  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  40.72 
 
 
395 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4155  phosphoserine aminotransferase  40.38 
 
 
360 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  41.99 
 
 
377 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  40.72 
 
 
361 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0433  phosphoserine aminotransferase  41.48 
 
 
360 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2998  phosphoserine aminotransferase  41.48 
 
 
360 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0922  phosphoserine aminotransferase  40.93 
 
 
360 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0918  phosphoserine aminotransferase  40.93 
 
 
360 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  41.05 
 
 
363 aa  287  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2576  phosphoserine aminotransferase  41.48 
 
 
360 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0951  phosphoserine aminotransferase  41.48 
 
 
360 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2886  phosphoserine aminotransferase  41.48 
 
 
360 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2949  phosphoserine aminotransferase  41.48 
 
 
360 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0197  phosphoserine aminotransferase  41.48 
 
 
360 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1278  phosphoserine aminotransferase  41.87 
 
 
360 aa  285  7e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0563  phosphoserine aminotransferase  40.11 
 
 
360 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1042  phosphoserine aminotransferase  40.11 
 
 
360 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943212  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1001  phosphoserine aminotransferase  40.11 
 
 
360 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  41.14 
 
 
365 aa  285  8e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1395  phosphoserine aminotransferase  38.92 
 
 
371 aa  285  9e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.13819  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0903  phosphoserine aminotransferase  39.84 
 
 
378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  40.72 
 
 
361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  40.72 
 
 
361 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  40.33 
 
 
363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2465  phosphoserine aminotransferase  38.65 
 
 
371 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.394582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2708  phosphoserine aminotransferase  41.71 
 
 
375 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2803  phosphoserine aminotransferase  41.71 
 
 
375 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1952  phosphoserine aminotransferase  41.05 
 
 
361 aa  282  5.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132565  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2262  phosphoserine aminotransferase  40.93 
 
 
360 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.022425  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1634  phosphoserine aminotransferase  40.22 
 
 
360 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2622  phosphoserine aminotransferase  41.44 
 
 
375 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.699254  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2240  phosphoserine aminotransferase  38.52 
 
 
366 aa  281  9e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12357  predicted protein  41.16 
 
 
394 aa  281  1e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169231  normal  0.290006 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  40.88 
 
 
359 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  40.33 
 
 
360 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2671  phosphoserine aminotransferase  40.44 
 
 
361 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.146724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2583  phosphoserine aminotransferase  40.44 
 
 
361 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00074187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>