More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2287 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2287  histidine kinase  100 
 
 		 387 aa  800    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000635078  normal  0.170007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2189  sensor histidine kinase  65.98 
 
 		 395 aa  522  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2728  histidine kinase  56.36 
 
 		 387 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1890  histidine kinase  46.38 
 
 		 384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00251613  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1375  histidine kinase  43.68 
 
 		 447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3006  histidine kinase  39.42 
 
 		 394 aa  259  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2301  histidine kinase  40.05 
 
 		 386 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229596 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2970  histidine kinase  40.27 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0902  histidine kinase  39.47 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000164355  hitchhiker  0.00000000561176 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2053  histidine kinase  40.87 
 
 		 391 aa  249  7e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 377 aa  248  9e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1412  histidine kinase  38.57 
 
 		 381 aa  236  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0278  histidine kinase  37.87 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.284649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0880  histidine kinase  35.23 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3366  histidine kinase  34.46 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2934  histidine kinase  36.71 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.257215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1696  histidine kinase  30.55 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0566842  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3335  histidine kinase  34.55 
 
 		 404 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248975  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 589 aa  83.2  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 815 aa  80.9  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 665 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  28.23 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 991 aa  72.4  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4160  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.25 
 
 		 516 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 585 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 557 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  28.4 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 592 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0481  response regulator receiver protein  26.37 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0653  histidine kinase  28.86 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0660  histidine kinase  28.86 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0673  histidine kinase  28.86 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 585 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.57 
 
 		 516 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  26.92 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2351  histidine kinase  28.88 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.1 
 
 		 458 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  27.24 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 591 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.63 
 
 		 905 aa  66.6  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0175  histidine kinase  29.17 
 
 		 597 aa  66.6  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  30.9 
 
 		 573 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 		 680 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.2 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0483  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 524 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 524 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 1171 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2145  histidine kinase  31.53 
 
 		 610 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  37.61 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1579  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.1 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000246185  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  28.07 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  29.54 
 
 		 582 aa  63.5  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 974 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1360  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1030  histidine kinase  25.1 
 
 		 261 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.975788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 		 1053 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0429  ATP-binding region ATPase domain protein  24.05 
 
 		 568 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.796172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0478  histidine kinase  28.46 
 
 		 560 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1175  histidine kinase  21.76 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.158069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 467 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 738 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13453  sensor histidine kinase/response regulator  34.55 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.264615  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  26.82 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  27.93 
 
 		 1298 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2655  sporulation kinase B  23.94 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.346759  hitchhiker  0.000000573688 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1246  histidine kinase  28.63 
 
 		 762 aa  60.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0158  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 684 aa  61.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 929 aa  60.8  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.33 
 
 		 553 aa  60.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  29.15 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.04 
 
 		 784 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 843 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2720  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 657 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  25.33 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 		 975 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  34.31 
 
 		 611 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 587 aa  59.7  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  29.74 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 720 aa  59.7  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.916012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  29.74 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  26.51 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  26.05 
 
 		 474 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  29.74 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0082  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 837 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  29.74 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 663 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0606  sensor kinase CusS  34.45 
 
 		 124 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1470  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 		 755 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.797654  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0988  histidine kinase  35.14 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.638134  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 590 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1926  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  19.74 
 
 		 697 aa  59.3  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0727  sensor kinase CusS  34.75 
 
 		 124 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 		 1038 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  26.51 
 
 		 474 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.35 
 
 		 1041 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>