More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1030 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1030  histidine kinase  100 
 
 
261 aa  529  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.975788  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2855  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
348 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
665 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2278  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
357 aa  145  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.530752  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
589 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0481  response regulator receiver protein  31.9 
 
 
523 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0483  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
524 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
524 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3999  sensor histidine kinase  30.49 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.71 
 
 
768 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2194  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
858 aa  77  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.857252  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.71 
 
 
770 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1890  histidine kinase  29.29 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00251613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 
1203 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  28.63 
 
 
771 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  28.63 
 
 
769 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
672 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  28.63 
 
 
771 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
591 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.456575  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  28.63 
 
 
771 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  28.63 
 
 
771 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  28.63 
 
 
772 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  28.63 
 
 
771 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
557 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 
1058 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 
656 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 
1002 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.4 
 
 
1499 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 
929 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  28 
 
 
576 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 
654 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 
1143 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
514 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108097  normal  0.083954 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.1 
 
 
768 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.1 
 
 
768 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.1 
 
 
768 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
469 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 
666 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 
666 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  28.23 
 
 
1161 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  29.09 
 
 
800 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 
630 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1871  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 
842 aa  68.6  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.464371  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2640  histidine kinase  26.09 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.976353  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.91 
 
 
1201 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  23.94 
 
 
1131 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
488 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.94 
 
 
807 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  28.25 
 
 
508 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
643 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
467 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.93 
 
 
969 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.66 
 
 
1162 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5387  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 
375 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0971839 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.24 
 
 
969 aa  67  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  29.62 
 
 
464 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  29.46 
 
 
513 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  26.03 
 
 
367 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
512 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
898 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  28.12 
 
 
835 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
646 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4467  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
589 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0773722  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  27.69 
 
 
629 aa  66.6  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  24.78 
 
 
1196 aa  66.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
1010 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  27.35 
 
 
470 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2189  sensor histidine kinase  23.93 
 
 
395 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.23 
 
 
790 aa  65.9  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  27.51 
 
 
648 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.09 
 
 
1145 aa  65.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  27.82 
 
 
1206 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.86 
 
 
827 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4448  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
589 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
661 aa  65.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2728  histidine kinase  25.21 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.9 
 
 
1037 aa  65.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
585 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 
781 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
620 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.51 
 
 
631 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.51 
 
 
678 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
741 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1314  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.35 
 
 
573 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.37 
 
 
1643 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
504 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
625 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2053  histidine kinase  29.15 
 
 
391 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1538  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
394 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461461  normal  0.397408 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1328  histidine kinase  27.5 
 
 
672 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0735  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 
841 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310558  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1561  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
443 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
498 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4312  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
591 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  25.97 
 
 
461 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
551 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  28.37 
 
 
1200 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.64 
 
 
721 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  28.46 
 
 
1361 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>