120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1937 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1937  Methyltransferase type 11  100 
 
 
274 aa  545  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.580554  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5473  methyltransferase type 11  38.59 
 
 
293 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0764  Methyltransferase type 11  38.31 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  37.82 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  38.94 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  41.35 
 
 
299 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0251  methyltransferase type 11  40.2 
 
 
165 aa  56.2  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.999818 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  39.73 
 
 
225 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
210 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  38.79 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
310 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.01 
 
 
258 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1298  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
165 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
202 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
218 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.65 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
487 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  38.61 
 
 
246 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.84 
 
 
240 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  41.76 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.86 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  31.16 
 
 
663 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  27.97 
 
 
217 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  36.59 
 
 
241 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.92 
 
 
155 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.56 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  34.74 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1513  hypothetical protein  30.08 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  0.422698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  34.65 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
544 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  30.93 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  38.71 
 
 
207 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
248 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 
216 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  30.15 
 
 
216 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  39.51 
 
 
212 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.58 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  33.33 
 
 
248 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.88 
 
 
230 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
282 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  37.66 
 
 
226 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
285 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  37.97 
 
 
212 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
285 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  31.31 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.64 
 
 
279 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
417 aa  46.6  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1607  Methyltransferase type 11  35 
 
 
238 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
264 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  32.17 
 
 
410 aa  46.2  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  38.68 
 
 
194 aa  45.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.82 
 
 
255 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 
273 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 
220 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  33.66 
 
 
194 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  25.87 
 
 
332 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
194 aa  45.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
324 aa  45.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4585  Methyltransferase type 11  38 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  26.47 
 
 
332 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  34.06 
 
 
233 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  35.44 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
457 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1562  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.940117 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  28.07 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  29.41 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
235 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
810 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  38.18 
 
 
177 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1867  hypothetical protein  29.41 
 
 
213 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
275 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.41 
 
 
325 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  32.64 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  31.43 
 
 
209 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  32.32 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
341 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.7 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
231 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35 
 
 
233 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
328 aa  43.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
213 aa  43.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  27.47 
 
 
259 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4787  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0659987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.79 
 
 
230 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>