More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3614 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3614  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
816 aa  1627    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.42 
 
 
818 aa  658    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215675  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
807 aa  714    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0213  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44 
 
 
807 aa  616  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.344812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 
807 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.93 
 
 
830 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2677  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.45 
 
 
818 aa  363  8e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.730239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.49 
 
 
540 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 
557 aa  213  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.35 
 
 
423 aa  211  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.87 
 
 
542 aa  210  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 
540 aa  210  9e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  38.44 
 
 
544 aa  209  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.01 
 
 
637 aa  209  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  35.51 
 
 
539 aa  207  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.51 
 
 
546 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.86 
 
 
541 aa  207  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  33.97 
 
 
541 aa  206  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 
640 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  37.12 
 
 
652 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.99 
 
 
541 aa  206  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 
541 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.1 
 
 
544 aa  204  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  36.02 
 
 
642 aa  204  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.23 
 
 
544 aa  204  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.67 
 
 
539 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.69 
 
 
540 aa  202  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.47 
 
 
540 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  36.2 
 
 
541 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.07 
 
 
642 aa  200  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.92 
 
 
547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.14 
 
 
637 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.25 
 
 
549 aa  198  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.67 
 
 
474 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000647381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  36.01 
 
 
549 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.9 
 
 
650 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  36.17 
 
 
541 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.31 
 
 
544 aa  197  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.12 
 
 
681 aa  197  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 
541 aa  197  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.1 
 
 
601 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.22 
 
 
544 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.11 
 
 
592 aa  196  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.334447 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 
550 aa  196  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 
646 aa  195  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  37.28 
 
 
676 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.32 
 
 
673 aa  195  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  38.11 
 
 
543 aa  195  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.17 
 
 
541 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 
425 aa  195  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.22 
 
 
542 aa  194  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  38.6 
 
 
541 aa  194  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  38.71 
 
 
541 aa  194  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.48 
 
 
541 aa  194  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 
541 aa  194  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.83 
 
 
543 aa  194  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.15 
 
 
661 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  37.36 
 
 
549 aa  192  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 
629 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 
541 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 
541 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 
716 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 
541 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  35.75 
 
 
713 aa  191  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.06 
 
 
568 aa  191  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.13 
 
 
542 aa  191  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4192  chemotaxis sensory transducer  39.22 
 
 
654 aa  191  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.13 
 
 
674 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  36.16 
 
 
546 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 
541 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 
541 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0175031  normal  0.083895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3925  methyl-accepting chemotaxis protein  31.37 
 
 
674 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.903723  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 
541 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100295  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  34.88 
 
 
712 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 
541 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  36.31 
 
 
543 aa  189  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  34.59 
 
 
712 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 
541 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  38.81 
 
 
541 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.72 
 
 
639 aa  189  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.39 
 
 
541 aa  189  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01518  hypothetical protein  33.99 
 
 
674 aa  188  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.24 
 
 
624 aa  188  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  34.56 
 
 
663 aa  188  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  35.88 
 
 
633 aa  188  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 
570 aa  188  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0916  methyl-accepting chemotaxis protein  34.8 
 
 
394 aa  187  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00484593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.63 
 
 
666 aa  187  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.58 
 
 
541 aa  187  7e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.81 
 
 
541 aa  187  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000434326  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  35.76 
 
 
541 aa  187  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.33 
 
 
537 aa  187  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.2 
 
 
540 aa  187  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  35.81 
 
 
549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.55 
 
 
540 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.46 
 
 
540 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1117  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.53 
 
 
541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0100073  normal  0.0339889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.16 
 
 
636 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.82 
 
 
739 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 
549 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>