141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0524 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0524  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
158 aa  327  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1385  Thioredoxin domain protein  70.25 
 
 
158 aa  247  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0813  thioredoxin  43.71 
 
 
151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0671  thioredoxin  41.33 
 
 
139 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0659  thioredoxin  41.33 
 
 
139 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0671  thioredoxin domain-containing protein  44.37 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0828  putative thioredoxin  41.33 
 
 
139 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7466400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0920  putative thioredoxin  40.67 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0721  thioredoxin  40.67 
 
 
139 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0757  thioredoxin  40.67 
 
 
139 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0822  thioredoxin, putative  39.33 
 
 
139 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.678614  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4521  thioredoxin  40.4 
 
 
150 aa  123  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0370852 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0636  thioredoxin domain-containing protein  38.06 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1403  thioredoxin  35.26 
 
 
161 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0180  hypothetical protein  26.25 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000228172  hitchhiker  3.99309e-36 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0118  hypothetical protein  27.5 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00137916  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0179  hypothetical protein  26.25 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0014  hypothetical protein  24.68 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.106983  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0087  hypothetical protein  28.1 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0020  disulfide bond formation protein A  27.43 
 
 
138 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000839687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  32.18 
 
 
109 aa  52.4  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  32.26 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2559  YdfQ  32.47 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.5439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  31.03 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  29.03 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  27.45 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  28.89 
 
 
113 aa  50.8  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  34.57 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  29.91 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  31.87 
 
 
109 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  28.42 
 
 
116 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  31.87 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0162  thioredoxin domain protein  28.75 
 
 
129 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142979  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0815  thioredoxin-related  32.53 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221245  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  32.5 
 
 
102 aa  48.5  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  30.95 
 
 
113 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0459  Thioredoxin domain protein  32.1 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  29.29 
 
 
107 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1428  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.38 
 
 
440 aa  47.4  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.156652  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5533  thioredoxin domain-containing protein  27.55 
 
 
138 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  26.85 
 
 
106 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  30.95 
 
 
142 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4096  thioredoxin domain-containing protein  29.58 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.461798  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  31.76 
 
 
113 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  30.68 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  26.32 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  23.78 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0233  thioredoxin 1  27.27 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.362513  normal  0.185715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  25.84 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  34.21 
 
 
109 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  31.17 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  29.41 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  29.87 
 
 
106 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  26.92 
 
 
107 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  25 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  29.55 
 
 
107 aa  44.3  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  29.21 
 
 
107 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3093  hypothetical protein  27.96 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113283  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0459  Thioredoxin domain protein  26.32 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0621095  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  29.55 
 
 
107 aa  43.9  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 
176 aa  43.9  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0030  thioredoxin domain protein  29.87 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170038  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5011  thioredoxin  29.21 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  31.43 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  31.25 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2011  thioredoxin domain-containing protein  31.65 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  32.86 
 
 
107 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  27.38 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  26.44 
 
 
238 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  24.76 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  25 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0032  Thioredoxin domain protein  29.87 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  30.49 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  25 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1700  glutaredoxin 2  31.75 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.947077  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1632  thioredoxin domain-containing protein  25.23 
 
 
234 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0209029  normal  0.101537 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  31.58 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  27.38 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1775  thioredoxin  30.21 
 
 
92 aa  42.4  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  26.42 
 
 
108 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  28.74 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  33.82 
 
 
106 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3383  Thioredoxin domain protein  23.17 
 
 
123 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.346342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4857  thioredoxin  28.89 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0192827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4714  thioredoxin  28.89 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000126236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5225  thioredoxin  28.89 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0101764  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  29.33 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  25 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  27.63 
 
 
406 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  24.72 
 
 
144 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  26.73 
 
 
289 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  25.23 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  24.72 
 
 
144 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  26.73 
 
 
289 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5095  putative thioredoxin  28.89 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  29.63 
 
 
109 aa  41.6  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  32.43 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  26.97 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  26.26 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  24.11 
 
 
107 aa  41.6  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>