140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3093 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3093  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  297  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1262  Thioredoxin domain  24.71 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000573175  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  31.46 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  26.53 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  24.73 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  28.12 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  24 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  29.35 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.17 
 
 		 427 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  31.25 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  25.26 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  34.78 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  29.79 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  29.79 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  29.03 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  29.79 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  23.66 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  30.77 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  30.77 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1016  thioredoxin domain-containing protein  29.76 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  27.47 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  24 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  32.22 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  26.74 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  24 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  24 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  24 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  24 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  24 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  24 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  27.17 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  28.42 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  26.6 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  24 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  24 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0524  Thioredoxin domain protein  27.96 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  24 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  26.37 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  26.74 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  23.85 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  26.88 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0471  Thioredoxin domain  28.09 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  26.74 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0822  thioredoxin, putative  24.73 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.678614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  30.43 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  28.57 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  26.92 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  26.92 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0636  thioredoxin domain-containing protein  27.78 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196836  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5011  thioredoxin  28.74 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0671  thioredoxin domain-containing protein  30.23 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  27.91 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  27.17 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  24.42 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  31.17 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  28.09 
 
 		 456 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  28.09 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  32.22 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  25.61 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  27.03 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  26.6 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  23 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  27.06 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  30.59 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0760  ribosomal protein L12E/L44/L45/RPP1/RPP2-like protein  25.88 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.511664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  27.17 
 
 		 108 aa  42  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  26.88 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  31.94 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  27.85 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  31.94 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  31.94 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  23 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0920  putative thioredoxin  24.73 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  31.33 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  29.79 
 
 		 106 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0671  thioredoxin  23.66 
 
 		 139 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0659  thioredoxin  23.66 
 
 		 139 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  23 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  26.76 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  23 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  23 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  28.17 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  23 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  28.05 
 
 		 107 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  30.43 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  29.58 
 
 		 108 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  22.22 
 
 		 98 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  25.26 
 
 		 105 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1385  Thioredoxin domain protein  24.49 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  23 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  23 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  23 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  29.58 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0828  putative thioredoxin  23.66 
 
 		 139 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7466400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  28.89 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  24.47 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  26.09 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  30.99 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0813  thioredoxin  30.38 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4521  thioredoxin  30.38 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0370852 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>