More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1632 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1632  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 234 aa  477  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0209029  normal  0.101537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  62.96 
 
 		 107 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  31.68 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  56.19 
 
 		 106 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  54.29 
 
 		 106 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  50.47 
 
 		 107 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1862  thioredoxin domain-containing protein  54.78 
 
 		 112 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285789  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  49.53 
 
 		 107 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  49.53 
 
 		 107 aa  106  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  30.87 
 
 		 259 aa  101  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  52.88 
 
 		 107 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  28.1 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  30.54 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  29.57 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  43.93 
 
 		 107 aa  96.3  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  44.44 
 
 		 106 aa  92  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  46.81 
 
 		 107 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  45.79 
 
 		 119 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  43.52 
 
 		 106 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  43.52 
 
 		 106 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  45.74 
 
 		 107 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  43.93 
 
 		 107 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  45.79 
 
 		 106 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  44.44 
 
 		 106 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  44.23 
 
 		 107 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  44.86 
 
 		 106 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  40.74 
 
 		 106 aa  89.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  44.44 
 
 		 106 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  44.76 
 
 		 106 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  45.71 
 
 		 106 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  43.52 
 
 		 106 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  47.78 
 
 		 108 aa  87.8  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  47.19 
 
 		 105 aa  87  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  44.68 
 
 		 107 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  41.67 
 
 		 107 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  41.12 
 
 		 107 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  42.2 
 
 		 108 aa  86.3  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  40.95 
 
 		 109 aa  85.9  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00620  disulfide-isomerase precursor, putative  30.47 
 
 		 411 aa  85.1  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  46.67 
 
 		 108 aa  84.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41.49 
 
 		 148 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  43.82 
 
 		 107 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  42.16 
 
 		 107 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  46.74 
 
 		 120 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  43.82 
 
 		 107 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  45.65 
 
 		 108 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  41.9 
 
 		 104 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  36.22 
 
 		 125 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  42.55 
 
 		 107 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  44.57 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  40.57 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  46.67 
 
 		 108 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  41.49 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  40.62 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  46.74 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  39.62 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  42.7 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  42.7 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  44.94 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  42.7 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  40.38 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  42.7 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  42.22 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  42.22 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  40 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  45.56 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  43.33 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  40.78 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  44.44 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  38.53 
 
 		 109 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  42.7 
 
 		 107 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  41.35 
 
 		 106 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  43.52 
 
 		 106 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  43.48 
 
 		 109 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  37.37 
 
 		 110 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  41.57 
 
 		 107 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  43.52 
 
 		 106 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5011  thioredoxin  42.7 
 
 		 107 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  35.78 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  43.01 
 
 		 105 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  42.31 
 
 		 107 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  44.04 
 
 		 107 aa  80.9  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  43.62 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  44.94 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  43.52 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  40 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  41.94 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  40.38 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  45.16 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  37 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  45.88 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  42.22 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  38.95 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  40.62 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>