More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1862 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1862  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  230  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285789  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  63.11 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  55.45 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1632  thioredoxin domain-containing protein  54.78 
 
 		 234 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0209029  normal  0.101537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  55.45 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  54.46 
 
 		 106 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  47.57 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  49.51 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  48.54 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  48.54 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  48.04 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  47.57 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  45.1 
 
 		 106 aa  94.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  46.6 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  41.75 
 
 		 107 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  40.78 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  48.28 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  46.59 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  45.63 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  43.43 
 
 		 119 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  51.76 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  43.43 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  40.78 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  87  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  48.78 
 
 		 107 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  43.69 
 
 		 106 aa  87  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  48.78 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  47.67 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  42.42 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  46.07 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  46.91 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  43.69 
 
 		 106 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  42.57 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  40.21 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  43.33 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  43.33 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  47.56 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  43.3 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  42.57 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  47.56 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  44.19 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  44.19 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  40.21 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  44.19 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  44.19 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  42.72 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  45.98 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  43.68 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  44.83 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  40.62 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  40.59 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  44.83 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  44.19 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  46.34 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  43.18 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  43.56 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  45.35 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  42.57 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  44.83 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  42.57 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  44.83 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  44.83 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  44.19 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  48.24 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  41.58 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  39.81 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  43.68 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  45.36 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  42.06 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  38.24 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  43.33 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  42.27 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  42 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  43.33 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  41.94 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  45.24 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  39.22 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  40.21 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  41.24 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  41.24 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2110  thioredoxin  42.72 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000269278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5011  thioredoxin  37.25 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  41 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  37.25 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  38.53 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  48.24 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  44.33 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  47.06 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  48.28 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  48.78 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  47.06 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  41.94 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  45.88 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  39.22 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  38.24 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  42.16 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  48.24 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  39.25 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  48.78 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  41.46 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>