More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5533 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5533  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  38.83 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0020  disulfide bond formation protein A  31.48 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000839687  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  33.63 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  31.86 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  31.86 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  33.64 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  34.69 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  28.79 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  30.83 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  30.83 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  34.02 
 
 
106 aa  55.1  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  32.74 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  30.83 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1779  thioredoxin domain-containing protein  30.34 
 
 
111 aa  53.9  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0361393  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  30 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  30 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  30 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  30.69 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  32.08 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  36.47 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  35.58 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  36.78 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  35.37 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  35.24 
 
 
102 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  34.12 
 
 
105 aa  52  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  35.8 
 
 
108 aa  52  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  35.37 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  35.37 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  33.33 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  29.73 
 
 
105 aa  51.6  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  33.33 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  31.68 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  28.44 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  31.07 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  26.21 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  26.21 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  26.21 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  26.21 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  26.21 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  26.21 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  26.21 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  26.21 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  26.21 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  33.33 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0451  hypothetical protein  22.96 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00575582  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  34.12 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  25.96 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  25.96 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  31.25 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  28.4 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  23.58 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  29.52 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  25.96 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  25.96 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  25.96 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  31.68 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  29.2 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  30.56 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  32.23 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  29.13 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  30.56 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  29.13 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  31 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0524  Thioredoxin domain protein  25.45 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  33.73 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  28.07 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  28.04 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  28.57 
 
 
109 aa  48.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  30.1 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  31.63 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  29.41 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  32.38 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  30.48 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  28.28 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  32.04 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  29.73 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0087  hypothetical protein  25.37 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  30.25 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  28.28 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  26.67 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  27.83 
 
 
109 aa  47.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  27.18 
 
 
105 aa  47  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  25.77 
 
 
144 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  31.13 
 
 
104 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  31.4 
 
 
107 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0335  thioredoxin domain-containing protein  32.05 
 
 
150 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  32.22 
 
 
104 aa  47  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4521  thioredoxin  27.08 
 
 
150 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0370852 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  26.21 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  28.83 
 
 
107 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  29.2 
 
 
112 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1978  thioredoxin  25.69 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.274716  normal  0.21653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  31.65 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  25.96 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  28 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  32.18 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  29.2 
 
 
112 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4889  Thioredoxin domain protein  29.36 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  29.76 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>