92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A1403 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A1403  thioredoxin  100 
 
 
161 aa  327  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0659  thioredoxin  40.29 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0828  putative thioredoxin  40.29 
 
 
139 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7466400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0671  thioredoxin  40.29 
 
 
139 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0920  putative thioredoxin  39.57 
 
 
139 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0671  thioredoxin domain-containing protein  36.99 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0822  thioredoxin, putative  38.85 
 
 
139 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.678614  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0757  thioredoxin  39.57 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0721  thioredoxin  39.57 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4521  thioredoxin  36.99 
 
 
150 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0370852 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0813  thioredoxin  36.73 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0636  thioredoxin domain-containing protein  35.21 
 
 
136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0524  Thioredoxin domain protein  35.26 
 
 
158 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1385  Thioredoxin domain protein  34.87 
 
 
158 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0087  hypothetical protein  34.56 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0020  disulfide bond formation protein A  31.25 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000839687  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0118  hypothetical protein  32.99 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00137916  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0179  hypothetical protein  30.21 
 
 
160 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0180  hypothetical protein  29.9 
 
 
160 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000228172  hitchhiker  3.99309e-36 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0014  hypothetical protein  30.21 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.106983  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  34.57 
 
 
109 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  30.77 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  28.4 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  33.33 
 
 
109 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  34.04 
 
 
223 aa  47.4  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01200  thioredoxin (trx), putative  26.04 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954839  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  28.16 
 
 
110 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  28.89 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  26.47 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  25.96 
 
 
105 aa  44.7  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  21.71 
 
 
145 aa  45.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  26.74 
 
 
148 aa  44.3  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  28.72 
 
 
139 aa  44.3  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  27.55 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  24.56 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  26.6 
 
 
406 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  24.44 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  25.74 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  28.74 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  29.07 
 
 
110 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  26.47 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  23.47 
 
 
106 aa  43.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  28.74 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  27.45 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  25 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  20.16 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  28.74 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  28.72 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  28.72 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  21.36 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  28.4 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  27.27 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  33.73 
 
 
109 aa  42.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  29.03 
 
 
107 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  28.05 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  25.49 
 
 
108 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10788  predicted protein  24.39 
 
 
117 aa  42.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  25.49 
 
 
108 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  25.49 
 
 
108 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  23.96 
 
 
106 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  26.83 
 
 
139 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  25.53 
 
 
324 aa  42  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3714  Thioredoxin domain protein  27.63 
 
 
143 aa  41.6  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  23.26 
 
 
141 aa  41.6  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  25.53 
 
 
320 aa  41.6  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  26.83 
 
 
108 aa  41.6  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  26.67 
 
 
107 aa  41.6  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1984  glutaredoxin 2  32.88 
 
 
92 aa  41.2  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  27.96 
 
 
107 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  27.85 
 
 
106 aa  41.2  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0459  Thioredoxin domain protein  30.88 
 
 
118 aa  41.2  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0621095  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  24.24 
 
 
110 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0162  thioredoxin domain protein  30.38 
 
 
129 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142979  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  23.96 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5011  thioredoxin  24.75 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  28.42 
 
 
108 aa  41.2  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  23.26 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  29.03 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  27.16 
 
 
108 aa  40.8  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  23.85 
 
 
107 aa  40.8  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  27.16 
 
 
108 aa  40.8  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  24.72 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  25.25 
 
 
108 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  25.25 
 
 
108 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  25.25 
 
 
108 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  25.49 
 
 
108 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  20.2 
 
 
106 aa  40.4  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  25.25 
 
 
108 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  25.49 
 
 
108 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  25.25 
 
 
108 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  25.25 
 
 
108 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  21 
 
 
111 aa  40.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>