44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2579 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  948    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  91.17 
 
 		 470 aa  850    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  26.77 
 
 		 580 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  25.65 
 
 		 492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  28.63 
 
 		 542 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1845  hypothetical protein  27.23 
 
 		 549 aa  112  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  26.94 
 
 		 592 aa  110  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  24.76 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  26.21 
 
 		 540 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  25.06 
 
 		 497 aa  103  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  25.28 
 
 		 581 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  26.02 
 
 		 560 aa  96.3  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  24.88 
 
 		 501 aa  95.1  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  24.89 
 
 		 561 aa  93.6  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  25.96 
 
 		 543 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  25.98 
 
 		 543 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1341  hypothetical protein  25.45 
 
 		 559 aa  89  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435658 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  25.43 
 
 		 494 aa  87.8  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  24.7 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  24.63 
 
 		 504 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  23.11 
 
 		 582 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  24.71 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  26.08 
 
 		 512 aa  77  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  27.78 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  25 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  25 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  25 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  26.17 
 
 		 501 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  24.64 
 
 		 491 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  25.1 
 
 		 494 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  23.95 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  24.15 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  23.42 
 
 		 490 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  25.25 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  24.83 
 
 		 490 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  25.39 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  26.45 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  24.5 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0054  hypothetical protein  27.19 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  24.4 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  24.94 
 
 		 488 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  24.03 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  25.1 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  21.91 
 
 		 488 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>