44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3925 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  67.47 
 
 		 501 aa  743    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  73.92 
 
 		 499 aa  790    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  66.8 
 
 		 497 aa  717    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  71.94 
 
 		 494 aa  795    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  68.43 
 
 		 501 aa  728    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  64.14 
 
 		 494 aa  660    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  1041    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  58.48 
 
 		 494 aa  623  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  59.01 
 
 		 491 aa  622  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  57.85 
 
 		 491 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  57.62 
 
 		 490 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  57.85 
 
 		 491 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  57.85 
 
 		 491 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  57.82 
 
 		 490 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  57.82 
 
 		 490 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  57.03 
 
 		 491 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  41.38 
 
 		 488 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  41.86 
 
 		 488 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  41.37 
 
 		 487 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  41.74 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  32.51 
 
 		 493 aa  209  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  30.58 
 
 		 512 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  27.82 
 
 		 477 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  26.7 
 
 		 504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  26.56 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  27.21 
 
 		 492 aa  123  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0276  hypothetical protein  25.3 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  25.71 
 
 		 497 aa  117  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  28.77 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0762  hypothetical protein  23.1 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000000752788  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0793  hypothetical protein  30.24 
 
 		 444 aa  94  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  25.54 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  24.71 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  30.16 
 
 		 542 aa  60.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  28.35 
 
 		 540 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  22.97 
 
 		 561 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  27.07 
 
 		 448 aa  54.3  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  26.29 
 
 		 560 aa  53.5  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  24.05 
 
 		 581 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  29.05 
 
 		 580 aa  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  25.58 
 
 		 543 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  26.67 
 
 		 582 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  23.55 
 
 		 543 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3738  hypothetical protein  22.37 
 
 		 512 aa  43.9  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.99619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>