39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0775 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  100 
 
 
580 aa  1192    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  44.06 
 
 
592 aa  476  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1845  hypothetical protein  32.76 
 
 
549 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  32.47 
 
 
560 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  31.78 
 
 
542 aa  233  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1341  hypothetical protein  32.88 
 
 
559 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435658 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  29.38 
 
 
540 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  31.55 
 
 
543 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  29.41 
 
 
543 aa  211  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  26.77 
 
 
464 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  26.76 
 
 
470 aa  126  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  26.81 
 
 
581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  25.61 
 
 
561 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  24.62 
 
 
582 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  31.42 
 
 
492 aa  97.8  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  26.88 
 
 
477 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  29.39 
 
 
483 aa  95.1  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  26.35 
 
 
497 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  26.72 
 
 
504 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  32.34 
 
 
512 aa  62  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  26.29 
 
 
497 aa  60.8  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  25.51 
 
 
501 aa  60.1  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  27.84 
 
 
487 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  25.91 
 
 
488 aa  56.2  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  29.71 
 
 
488 aa  55.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  26.94 
 
 
488 aa  54.7  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  28.65 
 
 
499 aa  54.3  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  24 
 
 
448 aa  54.3  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  29.51 
 
 
501 aa  53.9  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  33.72 
 
 
485 aa  48.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  25.5 
 
 
494 aa  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  29.05 
 
 
499 aa  48.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  27.84 
 
 
494 aa  47.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  28.57 
 
 
493 aa  46.6  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  25.29 
 
 
494 aa  47  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  25.95 
 
 
490 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  29.73 
 
 
490 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  29.73 
 
 
490 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  30.09 
 
 
491 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>