23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1341 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  60.44 
 
 		 543 aa  654    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  62.07 
 
 		 543 aa  663    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1341  hypothetical protein  100 
 
 		 559 aa  1130    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435658 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  61.65 
 
 		 540 aa  674    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  55.72 
 
 		 542 aa  631  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1845  hypothetical protein  58.08 
 
 		 549 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  56.72 
 
 		 560 aa  589  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  32.88 
 
 		 580 aa  253  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  28.57 
 
 		 592 aa  213  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  25.39 
 
 		 464 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  26.17 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  24.22 
 
 		 581 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  23.34 
 
 		 582 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  22.03 
 
 		 561 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  24.68 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0054  hypothetical protein  23.97 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2662  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  24.34 
 
 		 492 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  22.6 
 
 		 497 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  23.81 
 
 		 504 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  23.5 
 
 		 512 aa  53.5  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  22.75 
 
 		 477 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3738  hypothetical protein  22.04 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.99619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  24.1 
 
 		 448 aa  47.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>