41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1635 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  90.79 
 
 		 543 aa  983    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1099    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1341  hypothetical protein  62.07 
 
 		 559 aa  633  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435658 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  58.29 
 
 		 540 aa  629  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1845  hypothetical protein  56.4 
 
 		 549 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  53.45 
 
 		 542 aa  571  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  55.02 
 
 		 560 aa  550  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  31.22 
 
 		 580 aa  231  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  27.13 
 
 		 592 aa  189  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  24.34 
 
 		 581 aa  97.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  25.91 
 
 		 464 aa  91.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  26.73 
 
 		 470 aa  91.3  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  23.85 
 
 		 582 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  23.19 
 
 		 561 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  26.16 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0054  hypothetical protein  25.1 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  23.93 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  25.98 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  25.36 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  25.31 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  27.8 
 
 		 501 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  25.29 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  27.22 
 
 		 512 aa  54.7  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  25.99 
 
 		 494 aa  53.9  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3738  hypothetical protein  24.01 
 
 		 512 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.99619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  31.16 
 
 		 487 aa  51.2  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  27.61 
 
 		 488 aa  51.2  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  24.42 
 
 		 490 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  24.81 
 
 		 490 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  23.93 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  29.29 
 
 		 488 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  27.13 
 
 		 499 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  24.42 
 
 		 490 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  24.55 
 
 		 497 aa  47.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  28.26 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  25.58 
 
 		 499 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  25.95 
 
 		 491 aa  45.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  23.61 
 
 		 494 aa  44.3  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  23.85 
 
 		 491 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  23.85 
 
 		 491 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  23.85 
 
 		 491 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>