21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3738 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3738  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1064    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.99619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  32.29 
 
 		 448 aa  256  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0054  hypothetical protein  27.15 
 
 		 467 aa  208  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2662  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  22.45 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  26.67 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  23.14 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  24.9 
 
 		 540 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  25.27 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  21.56 
 
 		 488 aa  54.7  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1845  hypothetical protein  27.11 
 
 		 549 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  22.19 
 
 		 483 aa  53.9  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  23.47 
 
 		 543 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  22.03 
 
 		 542 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  21.34 
 
 		 504 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  22.14 
 
 		 501 aa  50.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  22.87 
 
 		 491 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  22.83 
 
 		 492 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  22.74 
 
 		 543 aa  47.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  23.62 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  23.01 
 
 		 477 aa  43.9  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  22.37 
 
 		 499 aa  43.9  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>