34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4204 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  931    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3738  hypothetical protein  32.29 
 
 
512 aa  256  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.99619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0054  hypothetical protein  32.81 
 
 
467 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  26.45 
 
 
464 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  25.62 
 
 
470 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  22.85 
 
 
501 aa  67  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  23.85 
 
 
501 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  23.93 
 
 
543 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  24.9 
 
 
497 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  24.38 
 
 
497 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  23 
 
 
543 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  23.73 
 
 
494 aa  60.5  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  23.58 
 
 
540 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  21.14 
 
 
499 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  25 
 
 
491 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  25 
 
 
491 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  25 
 
 
491 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  24 
 
 
580 aa  54.3  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  27.07 
 
 
499 aa  54.3  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  22.22 
 
 
494 aa  53.9  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  23.36 
 
 
490 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  23.83 
 
 
490 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  23.36 
 
 
490 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  24.49 
 
 
560 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  21.23 
 
 
494 aa  50.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  22.64 
 
 
491 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  21.43 
 
 
542 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  22.8 
 
 
488 aa  47.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  21.08 
 
 
492 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  22.19 
 
 
487 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  19.74 
 
 
483 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  23.57 
 
 
477 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  23.2 
 
 
491 aa  44.3  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  21.79 
 
 
504 aa  43.5  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>